大豆抗大豆胞囊线虫候选基因鉴定及KASP标记开发

《Theoretical and Applied Genetics》：Identification of candidate genes associated with resistance to Heterodera sojae in soybean

来自韩国的研究人员为应对新发现的大豆病原线虫Heterodera sojae的危害，开展了大豆抗性基因挖掘研究。他们通过全基因组关联分析（GWAS）在385份大豆种质中鉴定出13个显著SNPs，并基于位于1号和18号染色体的4个SNPs开发了KASP标记，成功筛选出16个在大豆根部特异表达的候选基因。该研究为大豆抗线虫育种提供了高效的分子标记辅助选择工具。

　　

科学家们成功鉴定出与大豆抵抗大豆胞囊线虫（Heterodera sojae）相关的候选基因。这种新发现的线虫会寄生在大豆根部，严重影响大豆的生长和产量。为了找到抵抗这种害虫的基因，研究人员对385份不同的大豆品种进行了全基因组关联分析（GWAS），使用了Axiom 180K SoyaSNP芯片和全基因组测序数据。

分析结果共找到了13个与抗性显著相关的单核苷酸多态性（SNP）。其中，位于1号和18号染色体上的4个SNP被重点研究，用于寻找候选的抗性基因，并开发了一种高效的基因分型工具——竞争性等位基因特异性PCR（KASP）标记。通过单倍型分析，科学家们在靠近这些显著SNP的区域发现了两个单倍型块，其中包含了16个候选基因。根据JGI植物基因图谱的预测，这些候选基因的功能与大豆根部特异性表达相关。

这项研究开发的KASP标记，未来可以广泛应用于大豆育种项目中，通过分子标记辅助选择（MAS）来快速培育出能够抵抗大豆胞囊线虫的优良大豆品种。