木瓜基因组编码microRNAs对番木瓜环斑病毒的转录后沉默作用：全基因组挖掘与RT-qPCR功能验证

《Virology》：Carica papaya genome -encoded microRNAs as post-transcriptional silencers of Papaya ringspot virus: A genome-wide mining and RT-qPCR-based functional validation

本研究通过生物信息学工具（miRanda/RNA22/psRNA Target/RNAhybrid）预测并实验验证了木瓜microRNAs（miRNAs）在番木瓜环斑病毒（PRSV）感染中的调控作用。研究发现cpa-miR159a等4种miRNAs显著上调，cpa-miR8140明显下调，揭示了miRNAs通过RNA干扰（RNAi）通路参与抗病毒防御的分子机制，为培育PRSV抗性木瓜品种提供了新靶点。

　　

研究亮点

PRSV感染木瓜的RNA分离与分子确认

从TNAU木瓜园采集具有PRSV典型症状的木瓜植株，通过PO₄缓冲液人工汁液接种将病毒保存在Co-8品种上。接种30天后，选取3株出现花叶和鞋带状畸形的病株与3株健康植株进行RNA提取。

感染木瓜的PRSV特征鉴定

接种后Co-8品种表现出严重卷叶、花叶、脉明和典型鞋带效应，与田间病株症状一致。通过CP基因特异性引物进行RT-PCR，成功扩增出1000bp的病毒cDNA条带，证实PRSV感染。

结论

本研究通过至少三种算法预测出6种在台湾、夏威夷和德里PRSV分离株中保守的miRNAs（如cpa-miR8140等）。该成果为理解木瓜miRNAs在PRSV感染应答中的作用提供了基础框架，尽管目前主要基于计算机预测，但为开发新型抗病毒策略奠定了重要基础。