新冠疫情期间英国ICU高毒力肺炎克雷伯菌传播的回顾性队列研究

《Infection Prevention in Practice》：Retrospective cohort study of Gram-negative bacteraemia shows transmission of hypervirulent Klebsiella pneumoniae in a UK Intensive Care Unit during the Covid-19 pandemic

本刊推荐：为探究新冠疫情期间ICU内革兰阴性菌血流感染(BSI)增加原因，研究人员通过回顾性队列研究结合全基因组测序(WGS)，发现高毒力肺炎克雷伯菌(hvKP)在患者间传播的证据，强调短袖防护服与强化清洁对控制超黏液性病原体传播的关键意义。

　　

当新冠疫情席卷全球时，英国皇家帕普沃斯医院重症监护室(ICU)的医生们注意到一个反常现象：尽管医院严格执行感染控制措施，由革兰阴性菌引起的血流感染(BSI)病例却持续攀升。尤其令人警惕的是，这些感染中肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)的比例显著增加，而部分患者出现了类似高毒力菌株引起的播散性感染症状。这种高毒力肺炎克雷伯菌(hvKP)通常具有超黏液表型，能引起肝、肺、脑等多器官感染，其K1/K2荚膜型和iuc、iro、rmp等毒力基因使其在医疗环境中传播风险极高。

为揭开这一谜团，剑桥大学医院NHS基金会信托基金的研究团队开展了一项回顾性队列研究，成果发表于《Infection Prevention in Practice》。研究人员系统分析了2020年4月至2021年12月期间ICU所有革兰阴性菌BSI病例，通过先进的基因组学技术追踪病原体传播路径，最终揭示了疫情期间感染控制环节的潜在漏洞。

关键技术方法包括：对41个复苏的冷冻菌株进行全基因组测序(Illumina NovaSeq平台)；使用欧洲药敏试验委员会(EUCAST)标准进行抗菌药物敏感性测试；通过SNP距离分析和多位点序列分型(MLST)判断菌株亲缘关系；利用Kleborate平台评估毒力基因谱。

研究结果方面：

初始观察显示疫情期间革兰阴性菌BSI月均发生率(3.2例)较2019年(1.5例)翻倍，其中肺炎克雷伯菌占比从27%升至42%。

抗菌药物敏感性及耐药基因组成表明菌株总体耐药率较低，仅20%的肠杆菌科菌株携带ESBL/AmpC基因，一株P. monteilii携带IMP-1金属碳青霉烯酶基因。

高毒力肺炎克雷伯菌特征方面，50%的肺炎克雷伯菌为高毒力型(5/10)，均携带K2/K57荚膜型和iuc、iro、rmp基因，且超黏液表型检测(拉丝试验)阳性。

患者间传播证据通过基因组分析确认3起传播事件：ST412型hvKP在患者35与21间传播(cgSNP=2)、ST86型hvKP在患者42与45间传播(cgSNP=1)、以及K. aerogenes *002b在患者22与37间传播(cgSNP=2)。流行病学调查发现传播均发生在相邻床位、共用医疗设备且采用集体护理模式的开放病区。

研究结论强调，尽管未发现广泛耐药菌株传播，但高毒力菌株的交叉感染凸显了疫情期间感染控制措施的薄弱环节。长袖防护服的持续使用可能阻碍了有效的手部卫生，而开放病区的集体护理模式增加了传播风险。作者建议优先采用短袖防护服以方便手部消毒，并对超黏液性菌株阳性患者实施强化隔离措施。该研究为后疫情时代ICU感染控制提供了关键循证依据，提示需要建立针对高毒力病原体的主动监测系统。