基于完整蛋白质组的甲硫氨酸氧化印迹新方法MOFIP:揭示蛋白质构象动态的结构洞察
《PROTEOMICS》:Methionine Oxidation Footprinting in Intact Proteins (MOFIP) Using Top-Down Proteomics
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时间:2025年10月22日
来源:PROTEOMICS 3.9
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本研究针对传统蛋白质印迹方法依赖酶切导致结构信息丢失的局限性,开发了完整蛋白质甲硫氨酸氧化印迹(MOFIP)技术。通过过氧化氢(H2O2)处理和大肠杆菌裂解液模型验证,成功在69种完整蛋白质形态中实现甲硫氨酸残基溶剂可及性的精准解析,为蛋白质构象研究提供了超越传统bottom-up策略的新视角。
在质谱技术驱动的蛋白质组学领域,科学家们开发出一种名为"完整蛋白质甲硫氨酸氧化印迹"的创新方法。这项技术通过让天然折叠的蛋白质样本与过氧化氢(H2O2)进行反应,巧妙地将甲硫氨酸残基的氧化程度转化为蛋白质三维结构的"分子尺"。与传统需要酶切处理的氢氘交换质谱等技术不同,这种自上而下的研究策略能够直接观测完整蛋白质形态的结构特征。
研究人员选用大肠杆菌裂解液作为复杂生物样本模型,成功对69种含甲硫氨酸的蛋白质形态进行精准分析。就像用X射线扫描蛋白质表面一样,暴露在溶剂中的甲硫氨酸会完全氧化,而埋藏在蛋白质内部的残基则保持原样。更有趣的是,部分氧化的中间状态暗示了蛋白质在天然环境中可能存在的构象动态平衡,比如与其他分子结合时的结构变化。
这项技术就像给蛋白质装上了"结构探针",为揭示蛋白质在生理环境中的真实构象提供了全新视角,特别是在研究蛋白质相互作用和构象变化等领域展现出独特优势。
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