基于微卫星标记与生态位模型的濒危药用植物云木香遗传多样性与保护策略研究

《Journal of Applied Research on Medicinal and Aromatic Plants》：Microsatellite marker resources, Genetic Diversity, Bottleneck, and Expected Habitat inferences for conservation of Critically Endangered Saussurea costus (Falc.) Lipsch

本文推荐采用分子生态学与物种分布模型（SDM）相结合的创新方法，系统评估极危物种云木香（Saussurea costus）的遗传多样性（Ho=0.24）、近交系数（FIS=0.48）、种群分化（FST=0.28）及未来栖息地适宜性（64%区域退化），为制定核心种质保护与分子育种策略提供关键科学依据。

　　

章节精选

植物材料与DNA提取

从西印度喜马拉雅地区（wIHR）的17个自然种群中共采集215株云木香个体。种群选择兼顾物种分布广度、地理跨度与生态异质性，每个地理种群包含10-15个基因型，单株间距10-20米以规避克隆株样本。

从头组装与注释

基于约3.217亿条高质量清洁读长的器官特异性转录组数据，从头组装获得110,272条转录本。经CD-HIT-EST去冗余后，73,719条转录本用于下游分析。读长回比评估显示96.93%原始读长可映射至组装序列，BUSCO完整性评估证实核心基因集覆盖度良好。

结论

本研究揭示云木香种群存在遗传多样性衰减、近交加剧、种群分化显著及遗传瓶颈效应，叠加未来64%栖息地退化风险，亟需通过核心基因型筛选与气候适应热点区划定，推动该濒危物种的保育与可持续利用。