曼谷休闲区环境酵母丰度与多样性评估及其对人类健康风险的启示

《Environmental Microbiology Reports》:Environmental Yeast Abundance and Diversity Assessment in Recreation Areas of Bangkok, Thailand

【字体: 时间:2025年10月23日 来源:Environmental Microbiology Reports 2.7

编辑推荐:

  本文首次系统评估泰国曼谷12个公共休闲区土壤与水源的酵母群落多样性,采用内部转录间隔区(ITS)测序技术鉴定出22属199株酵母菌,揭示念珠菌属(Candida)为优势菌群(22.11%)。研究发现人类活动强度、公园规模及周边环境显著影响酵母分布(p<0.05),高人流区域致病性酵母占比更高(45.23%),提示城市休闲环境可能存在机会性真菌感染风险。该研究为热带城市环境微生物生态学提供重要基线数据,并验证ITS区域在环境酵母鉴定中的适用性与局限性。

  
引言
热带与亚热带地区环境酵母群落多样性研究长期被低估。土壤和水体作为高度异质性生境,蕴含大量微生物资源。近年全球自然环境中已发现约340种酵母及类酵母真菌,主要分布于淡水、海洋、土壤及动植物体表。曼谷作为热带城市代表,其公共休闲区的人类活动可能显著改变酵母群落结构,增加致病性酵母比例,对频繁接触人群构成潜在感染风险。
实验方法
样本采集与处理
研究于2019-2021年旱季采集曼谷12个主要公园的158份样本(120份土壤、38份水体)。采样点覆盖圣堤帕公园(ST)、伦披尼公园(LP)等不同人流密度区域,采用GPS定位记录地理坐标。土壤样本取自10-15厘米深度,水体样本采集30厘米表层水,所有样本在24小时内处理。
酵母分离与筛选
样本经沙氏葡萄糖琼脂(SDA)培养基培养,添加氯霉素抑制细菌生长。通过乳酚棉蓝(LPCB)染色镜检确认酵母形态特征,包括圆形/卵圆形细胞、出芽结构及假菌丝形成。共获得321株酵母样分离株,经纯化后保存于-80°C甘油管。
分子鉴定与系统发育分析
采用NaOH沸水法提取基因组DNA,使用ITS5/ITS4引物扩增ITS区域(400-900 bp)。PCR产物经测序后通过BLASTn与GenBank数据库比对,以95%相似度界定属级分类,97%-100%界定种级分类。采用最大似然法(ML)构建系统发育树,使用IQ-TREE软件和iTOL可视化分析。
结果
酵母分离与鉴定
84份样本(53.16%)成功分离出酵母,形态学显示三类典型菌落:皱褶脑回状乳白色菌落、光滑凸起奶油色菌落及粘稠橙红色菌落。ITS区域扩增确认199株阳性分离株(62%),其中查图查克公园(CT)和皇后60周年纪念公园(GA)阳性率最高,圣堤帕公园(ST)最低。
酵母丰度与多样性
199株酵母分属22属,子囊菌门(45.23%)和担子菌门(49.25%)为主。念珠菌属(Candida)占比最高(22.11%),其次为红酵母属(Rhodotorula, 18.59%)、德巴利酵母属(Debaryomyces, 9.55%)等。5.53%菌株未能分类。香农多样性指数显示GA公园(1.948)和拉玛八世公园(RM, 1.952)多样性最高。
人类活动与酵母分布关联性
高人流公园(年访问量>40万人次)致病性酵母占比显著高于中等人流公园(90 vs 53株)。桑基图分析揭示人类访问量与致病酵母丰度呈正相关。公园周边环境(如临近市场、交通枢纽、河流)显著影响酵母群落组成,例如临近昭披耶河的RM公园虽人流较低但酵母多样性丰富。
系统发育分析
ITS序列相似性矩阵显示19个聚类群和15个单系群。念珠菌属和红酵母属呈现高度遗传多样性,分布于多个进化枝。密切相关的属(如Kwoniella与Papiliotrema)因ITS序列高度相似而未能有效区分,表明ITS区域在属级分类中的局限性。
讨论
本研究首次揭示曼谷休闲区环境酵母的群落特征,证实人类活动强度与致病酵母丰度的关联性。ITS区域虽可实现属级分类,但对近缘属的分辨力不足,建议结合D1/D2等其他标志物进行多基因分析。公园规模、水源类型(如河流引水)、有机质含量及周边城市化程度共同塑造酵母群落结构。
结论
曼谷公共休闲区蕴藏丰富的酵母多样性,其中机会性致病菌占比高达71.86%(143/199)。研究强调城市生态系统微生物监测的重要性,为公共卫生风险预警提供科学依据。后续研究需整合宏基因组学与表型分析,深入解析环境酵母的致病机制与传播途径。
相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号