综述:磷酸肌醇可视化和定量分析方法的进展
《FEBS Letters》:Spatiotemporal and quantitative analyses of phosphoinositides – fluorescent probe—and mass spectrometry-based approaches
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时间:2025年10月23日
来源:FEBS Letters 3
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这篇综述系统梳理了磷酸肌醇(PIs)研究领域的两大核心技术——活细胞荧光探针成像和质谱定量分析。文章详细介绍了各类PI物种(如PI(3)P、PI(4,5)P2、PIP3等)特异性探针的设计原理、应用局限与发展方向,同时深入解析了基于色谱-质谱联用(LC-MS/MS)的磷酸肌醇脂质组学方法在异构体区分、分子种定量方面的突破性进展。作者强调多学科技术交叉融合对于全面解码磷酸肌醇时空动态及功能机制至关重要。
磷酸肌醇:细胞信号传导的核心调控者
磷酸肌醇(phosphoinositides, PIs)作为真核细胞膜磷脂的关键组分,通过其肌醇环上特定位置的磷酸化修饰,形成包括PI(3)P、PI(4)P、PI(4,5)P2、PI(3,4,5)P3 (PIP3)等在内的多种信号分子。这些分子在膜运输、细胞骨架重组、增殖存活及代谢调控等生命过程中扮演着“分子开关”的核心角色。由于其含量低、代谢快且存在位置异构体,对PIs进行精确的时空解析与定量一直是领域内的重大挑战。近年来,基于荧光蛋白的活细胞成像技术和基于质谱的脂质组学分析取得了显著进展,为我们深入理解PIs的复杂生物学功能提供了强大工具。
荧光探针:照亮磷酸肌醇的细胞内动态
活细胞荧光成像技术的核心在于开发高特异性、高亲和力的结合模块。这些模块通常来源于天然蛋白质中能够识别特定PI头部的结构域,如PH结构域、PX结构域、FYVE结构域等。
磷脂酰肌醇(PI)探针:作为所有磷酸肌醇的前体,PI的分布研究相对滞后。细菌磷脂酶C(BcPI-PLC)与EGFP的融合蛋白(EGFP–BcPI-PLC)被用于示踪PI,发现PI在内质网和高尔基体等膜结构上富集,提示内质网可能是磷酸肌醇生物合成的主要起始位点。
PI(3)P探针:FYVE结构域,特别是串联的2xFYVE–GFP,是研究早期内体和自噬过程中PI(3)P动态的“金标准”。p40phox的PX结构域以及DFCP1(含双FYVE结构域的蛋白)也被用作补充工具,后者对自噬起始相关的omegasomes(内质网衍生的PI(3)P富集膜微区)有特异性标记。
PI(4)P探针:早期使用FAPP1、OSBP等蛋白的PH结构域,但其定位常依赖于与ARF1等蛋白的互作。源自细菌效应蛋白SidM的P4M结构域及其高亲和力版本P4Mx2,能更特异地标记高尔基体、晚期内体/溶酶体及质膜上的PI(4)P池,应用更为广泛。
PI(5)P探针:由于其丰度极低,成像难度大。ING2蛋白的PHD结构域和Tiam1的PH结构域曾被尝试用作探针,但特异性有待进一步提高,是当前探针开发的难点。
PI(3,4)P2探针:TAPP1蛋白的PH结构域是其主要探针。为提高灵敏度和特异性,开发了串联PH结构域(如3xTAPP1-PH)以及FRET(F?rster共振能量转移)传感器(如f-TAPP、Pippi-PI(3,4)P2),实现了对细胞膜和溶酶体上PI(3,4)P2动态变化的实时监测。
PI(4,5)P2探针:磷脂酶C δ1(PLCδ1)的PH结构域(PLCδ1-PH)是最经典、应用最广泛的工具,能高特异性地显示质膜上的PI(4,5)P2。Epsin-1的ENTH结构域、基于溶致变色染料的比率型探针以及FRET/二聚化依赖荧光蛋白(ddFP)传感器等新型工具,为定量研究提供了更多选择。
PI(3,5)P2探针:早期使用TRPML1通道的N端多碱基区(ML1N)。近期发现的盘基网柄菌SnxA蛋白的PX结构域,对PI(3,5)P2具有高亲和力和特异性,能清晰显示内溶酶体膜上PI(3,5)P2的不对称分布和动态变化。
PIP3探针:Grp1和Btk的PH结构域因其对PIP3的高选择性而优于可同时结合PI(3,4)P2的Akt-PH。此外,也出现了细胞穿透性的比率型肽探针,为无创检测提供了可能。
尽管荧光探针在揭示PIs的空间分布和瞬时动力学方面功不可没,但它们通常难以提供绝对定量信息,也无法区分不同脂肪酸组成的分子种。
质谱分析:精准定量磷酸肌醇的分子图谱
质谱(Mass Spectrometry, MS)技术的进步,特别是脂质组学(Lipidomics)的发展,为克服荧光探针的局限性、实现PIs的精确定量和分子种分析提供了强大支撑。
技术挑战与对策:PIs的强酸性、低丰度以及易受离子抑制等特点,使其在常规脂质组学分析中难以检测。通过优化提取方案(如酸性条件提取、DEAE纤维素富集)、采用三甲基硅烷基重氮甲烷(TMS-diazomethane)进行衍生化(甲基化磷酸基团以降低极性和提高离子化效率),显著提升了检测灵敏度和稳定性。
区分位置异构体:PI(3)P, PI(4)P, PI(5)P以及PI(3,4)P2, PI(3,5)P2, PI(4,5)P2等位置异构体的区分是分析的关键难点。目前发展的策略包括:使用手性色谱柱(如PRMC-MS技术)、超临界流体色谱(SFC)或基于碎片离子模式的算法,成功实现了七种磷酸化PIs异构体的分离与定量。
分析酰基链信息:通过碰撞诱导解离(CAD)产生的单酰基甘油(MAG)碎片离子,可以确定sn-1和sn-2位脂肪酸的组成。这使得研究人员能够解析超过200种具有不同酰基链构成的PI分子种,并发现特定刺激会诱导特定分子种的产生,提示了PI代谢的精确调控和功能特异性。
PRMC-MS等先进方法已成功应用于从酵母、果蝇、斑马鱼到小鼠及人类组织、血浆、外泌体等多种生物样本中PIs的全面分析,极大地拓展了我们对PIs在生理病理条件下作用的理解。
未来展望:技术融合开拓新视野
对磷酸肌醇生物学的全面理解需要时空动态信息与绝对定量数据的深度融合。未来,荧光探针的发展将致力于提高对难检测PI物种(如PI(5)P)的特异性、改善FRET传感器的动态范围和信噪比。质谱技术则将继续向着更高灵敏度、更高通量和更完善的数据分析算法迈进。
成像质谱(Imaging Mass Spectrometry, IMS)技术有望成为连接荧光成像与质谱定量的桥梁,它能在组织原位直接检测脂质分子,同时提供空间分布和化学结构信息。随着IMS空间分辨率的不断提升,未来或可实现亚细胞水平甚至细胞器水平的磷酸肌醇定位与定量,从而在健康和疾病状态下,以前所未有的精度解码磷酸肌醇信号网络的复杂动态。多学科技术的交叉与协同发展,必将持续推动磷酸肌醇研究领域走向新的深度和广度。
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