通过靶向蛋白质组学与全局蛋白质组学方法研究人类肝脏和肠道中临床相关药物代谢水解酶的蛋白质丰度：一项比较研究

《Journal of Proteome Research》：Protein Abundance of Clinically Relevant Drug-Metabolizing Hydrolases in Human Liver and Intestine by Targeted versus Global Proteomics Approaches: A Comparative Study

水解酶在药物代谢中的重要性及组织表达差异研究，比较靶向蛋白质组学与全蛋白质组学（TPA）定量方法。TPA在肝、肠S9样本中（n=5）显示更高精度（CV<20%）和更全面蛋白覆盖，发现肝脏中CES1表达最高，肠道中CES2最丰富，且两者表达谱存在显著组织特异性。研究证实TPA适用于解析水解酶的群体差异和个体变异特征。

　　

虽然细胞色素P450酶和UDP-葡萄糖醛酸转移酶在药物代谢中起主导作用，但水解酶也逐渐成为小分子以及抗体-药物结合物或肽-寡核苷酸结合物代谢的关键参与者。尽管水解酶非常重要，但它们在不同组织中的蛋白水平及其个体间的差异仍不甚明了。尽管靶向蛋白质组学在定量少量蛋白质时具有高选择性和准确性，但基于总蛋白质分析（TPA）的蛋白质组学方法在多重蛋白质定量方面表现出更优越的优势。我们对靶向蛋白质组学和基于TPA的蛋白质组学方法进行了对比研究，以测定人肝和肠S9组分中的12种临床相关水解酶（每种组分为5个样本）。基于TPA的全局蛋白质组学方法具有更高的精确度（变异系数<20%）和相当的灵敏度，并且其蛋白质覆盖范围更广，这是其固有的优势。TPA数据分析结果显示，目标蛋白质在肝脏中的丰度顺序为：CES1 > EPHX1 > CES2 > BPHL > PON3 > PON1 ～ AADAC > CTSA > DPP4；在肠道中的丰度顺序为：CES2 > ADA > DPEP1 ～ AADAC ～ EPHX1 > ALPI > DPP4 > CTSA > BPHL ～ CES1。本研究强调了基于TPA的全局蛋白质组学在表征水解酶在不同组织中的差异丰度及其个体间差异方面的实用性。