厄瓜多尔农村地区女性门诊患者尿路感染肠杆菌目细菌耐药基因分子特征及质粒谱分析

《BMC Infectious Diseases》：Molecular characterization of antimicrobial resistance genes and plasmid profiles in enterobacterales isolated from urinary tract infections in rural outpatient women in Otavalo, Ecuador

本研究针对厄瓜多尔奥塔瓦洛农村门诊女性尿路感染(UTI)患者，开展肠杆菌目细菌耐药基因分子特征研究。通过PCR检测发现blaTEM(87.01%)、blaCTX-M-1(44.16%)等ESBL基因高流行，MLST分析鉴定出E.coli ST10(8.93%)和K.pneumoniae ST15(28.57%)等高风险克隆。研究首次揭示该地区质粒介导的耐药传播机制，为土著人群抗微生物药物耐药性(AMR)防控提供关键证据。

　　

在抗微生物药物耐药性(AMR)全球危机背景下，尿路感染(UTI)作为第二大常见门诊疾病，其治疗正面临严峻挑战。尤其在农村和土著人群等医疗资源匮乏地区，文化障碍、抗生素滥用等问题交织，形成耐药菌传播的温床。厄瓜多尔奥塔瓦洛地区的农村女性，正是这样一个被主流医学研究忽视的高危群体。

为揭示这一特殊人群的耐药菌传播规律，Hernandez-Alomía等研究人员在《BMC Infectious Diseases》发表论文，对2021年10月至2022年2月期间收集的154株肠杆菌目临床分离株（包括137株大肠杆菌和14株肺炎克雷伯菌）展开系统研究。研究团队采用PCR技术检测11种耐药基因，通过质粒不相容群分型鉴定18种复制子类型，并利用多位点序列分型(MLST)技术解析菌株克隆特征。

主要技术方法概述

研究选取厄瓜多尔奥塔瓦洛地区农村门诊女性的381份尿液样本，经显微镜检查筛选出154株肠杆菌目菌株。采用Chelex-10法提取DNA后，通过终点PCR检测β-内酰胺酶基因（包括ESBL和碳青霉烯酶）及mcr-1基因。质粒不相容群分型采用PCR-based replicon typing技术，MLST分析则参照Pasteur和PubMed数据库标准流程，使用PHYLOViz软件构建最小生成树。

耐药基因筛查结果

研究发现四种主要耐药基因流行模式：bla_TEM基因以87.01%的检出率居首，其次为bla_CTX-M-1(44.16%)、bla_SHV(18.83%)和bla_CTX-M-9(13.64%)。值得注意的是，35.71%菌株携带单一耐药基因，37.01%携带双重耐药基因，其中bla_TEM+bla_CTX-M-1组合最为常见。测序鉴定出13种β-内酰胺酶变异体，包括TEM-1(窄谱β-内酰胺酶)和CTX-M-15(超广谱β-内酰胺酶)等关键亚型。

质粒不相容群分布特征

质粒分析显示IncFIB(90.1%)、IncF(71.43%)和IncY(13.63%)为优势不相容群。55.8%菌株携带单一质粒类型，23.4%携带双重质粒，其中FIB+F组合占51.30%。研究首次发现FIB+F+bla_TEM（20.13%）等复杂质粒-基因共存模式，揭示质粒介导的基因可塑性是耐药传播的关键机制。

分子分型与克隆分布

大肠杆菌MLST分析鉴定出33种序列型，ST10和ST3944各占8.93%，ST131和ST1193等国际高风险克隆亦被检出。值得注意的是，4株菌株未能匹配已知序列型，提示可能存在新型克隆。

肺炎克雷伯菌以ST15(28.57%)和ST25(21.43%)为主导，ST462被确定为克隆结构的核心节点。3株菌株未确定序列型，暗示本地特有克隆的进化。

研究结论与意义

该研究首次系统揭示厄瓜多尔农村地区UTI病原菌耐药分子特征：bla_TEM基因绝对优势流行，IncFIB/F质粒主导的基因水平转移，以及ST10(大肠杆菌)和ST15(肺炎克雷伯菌)等高风险克隆的社区传播。特别值得关注的是，人-动物界面接触和抗生素使用不规范可能是驱动耐药传播的关键因素。

研究成果为厄瓜多尔2026-2030年国家抗微生物药物耐药性防控计划提供科学依据，强调将基因组监测工具（如全基因组测序）纳入农村卫生系统的迫切性。研究建立的分子流行病学基线数据，对制定兼顾地域、性别和民族公平性的精准干预策略具有里程碑意义。