新型吲哚生物碱的高通量筛选：作为潜在的酪氨酸激酶抑制剂用于乳腺癌治疗

本研究通过计算机辅助药物设计技术，评估吲哚生物碱对乳腺癌受体酪氨酸激酶的抑制活性。通过分子对接和药代动力学分析发现，吲哚衍生物在结合能和氢键形成方面优于传统药物Sunitinib，且具有低毒性和良好药代特性，为新型乳腺癌治疗药物开发提供依据。

　　

摘要

引言：生物技术提供了驱动计算机辅助药物设计（CADD）的生物数据和分子见解，这是一种用于药物发现和开发的先进计算技术。它整合了生物学、化学和计算工具来识别和优化潜在的治疗化合物。生物技术与CADD之间的联系至关重要。吲哚结构在药物发现中的重要性突显了其在寻找新药物分子方面的特殊地位。了解吲哚生物碱的功能以及吲哚衍生物与受体酪氨酸激酶（如血小板衍生生长因子受体PDGFR）的结构-活性关系（SARs）对于开发针对乳腺癌等疾病的靶向疗法至关重要。合理的药物设计在药物开发过程中具有重要意义。本研究的目的是通过计算方法，探索并优化吲哚生物碱作为治疗乳腺癌等疾病的潜在候选药物。

方法：使用ChemAxon Marvin Sketch 5.11.5软件创建了吲哚生物碱的二维结构。利用Swiss ADME & pkCSM在线工具预测了吲哚生物碱的理化性质及其毒性。通过Autodock 1.1.2、MGL Tools 1.5.6、Discovery Studio Visualizer v20.1.0.19295、Procheck、Protparam工具和PyMOL等程序，利用分子对接技术研究了吲哚生物碱与目标受体（PDB: 5GRN）之间的相互作用。

结果：根据计算机模拟研究，所有吲哚生物碱及其衍生物均具有口服生物利用度、较低的毒性以及可接受的药代动力学特性。与传统药物苏尼替尼相比，所有吲哚生物碱的对接得分均较高。

讨论：吲哚生物碱作为乳腺癌治疗的新疗法选择具有巨大潜力，并有望促进药物化学家进行更全面的体内、体外、基于化学的研究。目前，我们的工作仅限于对吲哚类似物的计算机模拟研究，这为药物化学家进一步探索吲哚生物碱奠定了坚实的基础。

结论：吲哚生物碱在与受体相互作用时产生的结合能增加以及形成的氢键数量（距离小于3.40埃）为筛选适合进一步研究的吲哚生物碱提供了有价值的起点。吲哚生物碱的药代动力学和毒理学特性支持其作为新型癌症治疗候选物的潜力，有助于医学化学家开展更深入的体外和体内化学及药理学研究。