HOXA5介导的肿瘤-免疫界面空间重塑在癌症中的作用及其在AML发病机制中的新见解

《Frontiers in Immunology》:HOXA5-mediated spatial remodeling of tumor-immune interfaces across cancers promotes AML pathogenesis

【字体: 时间:2025年10月24日 来源:Frontiers in Immunology 5.9

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  本综述通过整合多组学数据(TCGA、GTEx、TISCH2、空间转录组等),系统揭示了HOXA5在33种癌症中的表达异质性、空间免疫调控功能及治疗潜力。研究证实HOXA5在实体瘤(如BRCA、LUAD)与血液肿瘤(如AML)中具有"双重人格"特性,其通过IGFBP3-TMEM219/PTN-NCL轴重塑肿瘤微环境,并首次发现巯基嘌呤(mercaptopurine)可作为靶向HOXA5的潜在治疗药物。该研究为HOXA5相关精准治疗策略提供了多组学证据链。

  
HOXA5在癌症中的表达异质性
通过对GTEx数据库的分析发现,HOXA5在正常肾上腺、输卵管和肾脏组织中高表达,同时在免疫细胞(如嗜碱性粒细胞、NK细胞)中也呈现较高表达水平。肿瘤细胞系(如子宫癌、肾癌、结直肠癌细胞系)同样显示HOXA5表达升高。泛癌转录组分析表明,HOXA5在胶质母细胞瘤(GBM)和急性髓系白血病(AML)中表达显著上调,而在乳腺癌(BRCA)和肺腺癌(LUAD)中表达下调。通过整合TCGA肿瘤样本与GTEx正常样本,研究发现超过75%的肿瘤类型存在HOXA5表达失调:在BRCA、LUAD、肺鳞癌(LUSC)和直肠腺癌(READ)中显著下调;在弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBC)、GBM和胰腺癌(PAAD)中显著上调。空间转录组学分析进一步证实,HOXA5在恶性肿瘤微区域中的表达显著高于非恶性区域,且与肿瘤细胞含量呈强正相关。
HOXA5的基因组和表观遗传学特征
cBioPortal分析揭示了HOXA5在多种癌症中的突变位点分布,其中扩增现象较为常见,特别是在食管癌(ESCA)中。拷贝数变异(CNV)分析显示HOXA5存在广泛的低水平扩增,而在卵巢癌(OV)和子宫癌肉瘤(UCS)中主要观察到显著缺失。HOXA5表达水平随着从缺失到扩增的CNV状态变化而逐步升高。在低级别胶质瘤(LGG)、肾乳头状细胞癌(KIRP)和ESCA中,HOXA5的CNV与mRNA表达呈正相关。甲基化模式分析显示,HOXA5在多种恶性肿瘤中存在显著的高甲基化现象。甲基化与表达的关系表现出肿瘤类型特异性:在肾嫌色细胞癌(KICH)、AML、肉瘤(SARC)和UCS中呈负相关;在胆管癌(CHOL)、GBM和睾丸生殖细胞肿瘤(TGCT)中呈正相关。eQTL-GWAS共定位分析表明,rs3757640(HOXA5)与癌症风险共享遗传变异,为共定位提供了强有力的证据(PP.H4.abf = 1)。
HOXA5在泛癌中的功能富集分析
HOXA5在不同肿瘤中表现出多样化的功能状态。在膀胱癌(BLCA)、结肠癌(COAD)、GBM、头颈部鳞癌(HNSC)和前列腺癌(PRAD)中,HOXA5与免疫相关通路呈显著负相关;而在LGG、OV和葡萄膜黑色素瘤(UVM)中呈正相关。代谢分析显示,在HOXA5高表达的BLCA和嗜铬细胞瘤(PCPG)中,类固醇激素生物合成和细胞色素P450介导的外源物代谢通路被激活,而在HOXA5高表达的COAD和肝细胞癌(LIHC)中这些通路被抑制。基因集变异分析(GSVA)表明,HOXA5与血管生成、分化、上皮间质转化(EMT)和干性呈正相关。TCPA分析鉴定出大量HOXA5相关蛋白,HOXA5与致癌通路显著相关,凸显了其在肿瘤发展中的重要作用。
HOXA5在肿瘤免疫微环境中的特征
HOXA5的免疫关联表现出肿瘤异质性。在BLCA、DLBC和皮肤黑色素瘤(SKCM)中,HOXA5与免疫调节因子呈负相关;在LUAD、LUSC和甲状腺癌(THCA)中呈正相关。肿瘤微环境(TME)评估证实了这一现象:在LUAD、LUSC和LGG中,HOXA5与免疫评分/基质评分呈正相关;在BLCA和肾透明细胞癌(KIRC)中呈负相关。多种算法将HOXA5与免疫浸润(如CD8+ T细胞、内皮细胞、成纤维细胞)和免疫检查点相关联。单细胞分析(OV:GSE154600;KIRC:GSE171306)将HOXA5定位于恶性细胞和成纤维细胞。HOXA5+恶性细胞和HOXA5+成纤维细胞比HOXA5-细胞表现出更强的外向通信信号。在卵巢癌HOXA5+恶性细胞中,IGFBP通路是关键介质;配体-受体分析表明,HOXA5+恶性细胞通过IGFBP3-TMEM219对成纤维细胞、上皮细胞、内皮细胞、单核细胞、M1巨噬细胞、增殖T细胞和浆细胞产生更强调控。在KIRC的HOXA5+成纤维细胞中,PTN通路主导通信作用,通过PTN-NCL对恶性细胞、肥大细胞、NK细胞、增殖T细胞、单核/巨噬细胞、中性粒细胞、CD4+传统T细胞、CD8+T细胞和内皮细胞产生更强调控。
HOXA5在AML中的预后价值
研究证实HOXA5在AML患者中显著高表达,且与外周血原始细胞百分比、FLT3突变和NPM1突变状态显著相关。高HOXA5表达预示AML患者总生存期(OS)显著缩短,这一发现在多个独立队列中得到验证。限制性立方样条(RCS)分析显示HOXA5表达与AML死亡风险呈线性关系。HOXA5表达最高四分位(Q1)患者死亡率最高。时间依赖性ROC分析显示1年、3年和5年AUC值分别为0.622、0.655和0.722。基于TARGET-AML数据集的分析表明,高HOXA5同样预示儿童AML不良预后(HR = 1.97)。多变量Cox回归确认HOXA5为独立预后因素。
HOXA5在AML中的免疫学特征
ESTIMATE分析显示HOXA5低表达组基质评分显著较低。免疫浸润分析表明,HOXA5高表达组嗜酸性粒细胞和活化NK细胞增加;HOXA5低表达组静息肥大细胞、滤泡辅助T细胞(Tfh)和γδ T细胞增加。单样本GSEA(ssGSEA)显示HOXA5低表达组iDC、肥大细胞、pDC和Tcm细胞浸润增强。TIP数据库分析表明HOXA5表达与Th2招募、Treg招募和一般免疫浸润呈正相关,但与启动和活化呈负相关。值得注意的是,HOXA5低表达组表现出更高的IFNγ评分、T细胞炎症评分和MeTIL评分。
HOXA5调控AML细胞增殖和细胞周期
在AML细胞系(U937、KG-1)中的功能研究采用两种独立siRNA。RT-qPCR和Western blot证实了高效的HOXA5敲低。HOXA5缺失显著抑制增殖(CCK-8实验)并诱导G0/G1期细胞周期阻滞,证明其在AML细胞周期调控和增殖中的关键作用。
HOXA5在AML中的机制研究
基因组分析揭示HOXA5与TWIST1、HOXA4和NCAM1相互作用。蛋白互作网络将HOXA5与HOXB4、HOXC6和HOXC4连接。比较HOXA5高/低表达组鉴定出1,494个差异表达基因(610个上调,884个下调)。WGCNA确定MEdarkolivegreen模块与HOXA5最相关。交叉分析获得45个核心正相关基因。GO-BP富集提示HOXA5参与前后轴模式和胚胎骨骼发育。GO-MF富集突出DNA结合转录激活活性(RNA Pol II特异性)和生长因子活性。GSVA显示HOXA5与血管生成/转移通路呈负相关。代谢分析表明HOXA5高表达AML中缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸生物合成被激活。GSEA显示HOXA5低表达AML中黏着斑、ECM-受体相互作用和原发性免疫缺陷通路富集。
HOXA5敲低KG-1细胞的RNA-seq鉴定出566个DEG(siHOXA5-1)和591个DEG(siHOXA5-2)。交集获得442个核心HOXA5调控DEG。富集分析将HOXA5与胆固醇生物合成、细胞-细胞黏附、ECM、免疫抑制和ECM-受体相互作用联系起来,与生物信息学发现一致。
HOXA5表达与药物敏感性的关联
CellMiner分析显示HOXA5与Alvocidib(CDK抑制剂)、阿法替尼(EGFR抑制剂)、普拉曲沙(抗叶酸剂)和氨基黄酮(芳烃受体激动剂)敏感性呈正相关;与芬维A胺(类视黄醇)、三氧化二砷、雷帕霉素(mTOR抑制剂)和LY-294002(PI3K抑制剂)呈负相关。PRISM分析证实HOXA5与U-18666A(胆固醇合成抑制剂)、阿替莫德(JAK2抑制剂)和来那替尼(HER2抑制剂)呈负相关。cMAP分析鉴定MK-886(FLAP抑制剂)作为对抗HOXA5介导肿瘤发生的潜在对策。巯基嘌呤(嘌呤拮抗剂)在AML中显示最强的负相关。分子对接研究预测HOXA5残基Thr200、Tyr202和Gln238可能形成氢键网络稳定药物复合物。
讨论与展望
HOXA5在癌症中表现出"双重人格":在实体瘤中主要发挥肿瘤抑制作用,而在血液肿瘤中转化为促癌因子。本研究通过多组学整合和功能验证,首次揭示了其在肿瘤空间免疫微环境中的关键作用,并确立了其在AML中的治疗靶点价值。未来研究方向包括:利用染色质构象捕获技术分析HOXA5的3D基因组调控网络;探索HOXA5表达与免疫检查点抑制剂(ICI)疗效的关系;基于HOXA5-硫嘌呤复合物结构设计变构抑制剂;开展靶向HOXA5的AML干预试验。
结论
HOXA5在泛癌中呈现"双重人格"特征:在实体瘤中主要发挥肿瘤抑制作用,而在血液恶性肿瘤中表现为致癌性。通过多组学整合和功能验证,本研究揭示了其在空间肿瘤免疫微环境中的关键作用,并确立了其在AML中的治疗靶点价值,为基于HOXA5的精准治疗奠定了基础。
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