小麦中病变模拟突变的全基因组解析：候选基因的鉴定与功能特征分析

《Theoretical and Applied Genetics》：Genome-wide dissection of lesion mimic mutations in wheat: identification and functional characterization of candidate genes

小麦创伤模拟性状的基因组分析鉴定了23个基因座及22个候选基因，其中3个基因通过自然多态性验证，揭示了多倍体作物复杂性状遗传机制，为抗病育种提供新靶点。

　　

摘要

“病斑模拟现象”（Lesion Mimics，LMs）指的是植物在没有病原体感染的情况下出现自发性坏死斑点的现象，这种现象与异常的免疫系统激活有关，并在解析植物免疫网络中起着关键作用。本研究采用了整合的基因组wide association study（GWAS）和 quantitative trait locus（QTL）分析策略，使用Wheat 660 K SNP芯片对349个关联样本进行了基因分型，同时使用Wheat 55 K SNP芯片对181个连锁群体进行了分析。GWAS分析共鉴定出696个与病斑模拟现象形成相关的显著SNP位点，其中10个位点在所有重复实验中均被一致检测到，其遗传变异效应（PVE）范围为13.17%至27.29%。QTL定位进一步确定了10个病斑模拟相关位点，其中qLM-7A.1和qLM-7D这两个位点通过两种方法均被检测到。随后，通过使用拟南芥（Arabidopsis）和水稻中的病斑模拟基因作为参考，通过同源BLAST分析鉴定了22个候选基因。通过对自然多态性的单倍型分析，发现了3个与病斑模拟表型显著相关的基因。这些发现不仅为抗病育种提供了新的靶标，还为研究多倍体作物中的复杂性状遗传学奠定了方法论基础。