优化5000份大豆（Glycine max (L.) Merrill）种质资源的获取：核心种质集的建立及最佳代表性子集的筛选

《Euphytica》：Streamlining 5000 soybean [Glycine max (L.) Merrill] germplasm accessions: core sets development and identification of the best representative subset

本研究针对印度 soybean 研究所收集的5000份种质资源，通过表型性状聚类和数量性状统计，结合不同采样与分配策略，筛选出15%样本量的最优核心集合体，有效管理种质资源同时保留遗传多样性。

　　

摘要

大豆（Glycine max (L.) Merrill）是一种自花授粉的豆科植物。为了丰富品种的遗传基础，提高遗传资源的利用效率至关重要，但由于种质资源数量庞大，其有效管理和评估变得较为困难。本实验旨在从印度中央邦印多尔市的大豆研究所收集的5000份样本中，筛选出一组具有代表性的核心种质。在班加罗尔农业科学大学，研究人员对这些样本以及3个对照品种进行了12个性状和7个数量性状的鉴定。研究发现，这些种质在性状上表现出显著的多态性，在数量性状上具有较高的遗传变异度。根据7个数量性状的调整均值，利用Ward层次聚类方法形成了10个不同的群体。最终基于两种核心样本规模（10%和15%）、两种采样策略（比例抽样和对数抽样）以及两种分配策略（随机分配和优先分配），开发出了8组大豆核心种质。作为验证标准，采用了基于性状统计量的方法（如卡方检验、类别覆盖率和Shannon–Weaver多样性指数）来评估种质的同质性、性状类别的保留情况以及多态性多样性；同时运用基于数量性状的多元统计方法来评估核心种质的代表性。结果表明，采用对数抽样和优先分配策略得到的15%规模的核心种质组是最能代表整个种质库的样本。本研究建立的最佳核心种质组能够在充分利用种质资源的同时，确保其遗传多样性的完整性。

大豆（Glycine max (L.) Merrill）是一种自花授粉的豆科植物。为了丰富品种的遗传基础，提高遗传资源的利用效率至关重要，但由于种质资源数量庞大，其有效管理和评估变得较为困难。本实验旨在从印度中央邦印多尔市的大豆研究所收集的5000份样本中，筛选出一组具有代表性的核心种质。在班加罗尔农业科学大学，研究人员对这些样本以及3个对照品种进行了12个性状和7个数量性状的鉴定。研究发现，这些种质在性状上表现出显著的多态性，在数量性状上具有较高的遗传变异度。根据7个数量性状的调整均值，利用Ward层次聚类方法形成了10个不同的群体。基于两种核心样本规模（10%和15%）、两种采样策略（比例抽样和对数抽样）以及两种分配策略（随机分配和优先分配），开发出了8组大豆核心种质。作为验证标准，采用了基于性状统计量的方法（如卡方检验、类别覆盖率和Shannon–Weaver多样性指数）来评估种质的同质性、性状类别的保留情况以及多态性多样性；同时运用基于数量性状的多元统计方法来评估核心种质的代表性。结果表明，采用对数抽样和优先分配策略得到的15%规模的核心种质组是最能代表整个种质库的样本。本研究建立的最佳核心种质组能够在充分利用种质资源的同时，确保其遗传多样性的完整性。