用于HIV阳性尼日利亚人群中肝细胞癌风险预测的循环游离DNA甲基化生物标志物

《International Journal of Cancer》：Circulating cell-free DNA methylation biomarkers for hepatocellular carcinoma risk prediction in HIV-positive Nigerian population

循环游离DNA甲基化联合AFP检测可显著提升尼日利亚HIV阳性人群肝癌筛查效能，随机森林模型AUC达97%，结合AFP后AUC升至98.5%。

　　

摘要

肝细胞癌（HCC）是全球癌症死亡的主要原因之一，在资源匮乏的环境中，尤其是HIV感染者（PLWH）中的发病率尤为高。由于缺乏基于影像的监测手段，以及目前生物标志物（如甲胎蛋白AFP）的敏感性较低，有效的早期检测仍然是一个重大挑战。我们对尼日利亚的一组HIV阳性患者（n=245）进行了全表观基因组关联研究（EWAS），这些患者被分为HCC组、肝硬化组（FibroScan ≥12.3 kPa）、纤维化组（FibroScan ≥7.6且<12.3 kPa）以及无HCC且无纤维化的组（FibroScan <7.6 kPa）。通过随机森林建模，我们开发并评估了一种用于HCC风险预测的游离循环DNA（ccfDNA）甲基化分类器（ccfDNAmRF）。我们发现了73个与HCC显著相关的CpG位点（假发现率<0.01）。ccfDNAmRF模型表现出很强的区分能力，能够以100%的敏感性和80%–91%的特异性区分HCC组、肝硬化组和无HCC组（曲线下面积AUC：92%–97%）。将ccfDNA甲基化风险评分与AFP结合使用后，分类准确性进一步提高（AUC高达98.5%）。值得注意的是，ccfDNA甲基化模式在疾病谱系中显示出明显的剂量-反应关系，这支持了其作为早期检测和风险分层的无创血液筛查工具的潜力。我们的研究结果强调了ccfDNA甲基化生物标志物的前景，它们可以作为非侵入性的血液检测方法，有助于提高HIV感染者中HCC病例的早期识别。

新进展

在资源匮乏的环境中，HIV感染者中的肝细胞癌负担尤为沉重。由于缺乏基于影像的监测手段，以及当前生物标志物（如甲胎蛋白）的敏感性较低，有效的早期检测受到限制。这项全表观基因组关联研究全面分析了尼日利亚HIV感染者中游离循环DNA的甲基化模式，以预测肝细胞癌的风险。研究结果表明，游离循环DNA的甲基化标志物可以增强甲胎蛋白检测的效果。这些发现为在资源有限的环境中采用无创的血液筛查策略来提高肝细胞癌的早期检测和风险分层提供了有希望的途径。

利益冲突声明

Masha Kocherginsky博士是美国专利9,149,485（“与糖皮质激素受体拮抗剂和乳腺癌相关的方法和组合物”）的发明人，该专利已由芝加哥大学授权给Corcept Therapeutics公司。所有其他作者声明，在进行这项研究时，不存在任何可能被视为潜在利益冲突的商业或财务关系。