对ASC1和APE2内含子在细胞适应性、转录及转录后动态中的作用的全面分析

《The FEBS Journal》：Comprehensive analysis of the role of ASC1 and APE2 introns on cellular fitness, transcription, and post-transcriptional dynamics

内含子影响酵母基因表达及细胞适应性：缺失内含子的ASC1和APE2基因突变体生长受阻，转录和RNA稳定性下降，mRNA核质转运增加但蛋白质表达缺失。

　　

摘要

研究发现，具有剪接能力的内含子几乎在转录到翻译的每一个阶段都会影响基因的表达。在这项研究中，我们全面分析了来自两种酵母基因ASC1和APE2的内含子在细胞适应性和基因表达不同阶段中的作用。含有无内含子版本的突变体比含有内含子的突变体生长速度慢30-60%，并且在乙醇和甘油培养基上的生长也受到抑制。此外，在没有内含子的情况下，这两种基因的编码区中R-loop信号增强。ASC1和APE2的稳态RNA水平分别降低了约30倍和50倍。新生转录分析显示，在无内含子的状态下，ASC1和APE2的转录量分别下降了4-10倍和2-5倍。这两种基因的mRNA半衰期在没有内含子的情况下缩短了2-3倍。荧光原位杂交方法检测到，在没有内含子的情况下，这两种基因的mRNA在细胞核中的滞留时间增加。通过Western blot检测蛋白质水平时，发现在没有内含子的情况下这两种蛋白质都检测不到。这些结果表明，这两种基因的内含子影响了基因在转录、mRNA稳定性和mRNA的核质运输方面的表达。此外，ASC1和APE2的内含子还影响了细胞的生长速率以及在不同碳源上的生长能力。

利益冲突

作者声明没有利益冲突。