《Journal of Rare Earths》：Protein Abundance of Clinically Relevant Drug-Metabolizing Hydrolases in Human Liver and Intestine by Targeted versus Global Proteomics Approaches: A Comparative Study
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本研究对比靶向蛋白质组与全蛋白质组分析（TPA）定量12种水解酶在肝脏和肠道S9样本中的效果，发现TPA在精度（CV<20%）和覆盖度上更优，揭示了组织特异性水解酶丰度差异及个体间变异。
Dilip Kumar Singh | Deepak Ahire | Robert S. Jones | Ryota Kikuchi | Bin Ma | Yu Tian | Ting Wang | Faizan Zubair | Scott Heyward | S. Cyrus Khojasteh | Bernard P. Murray | Bill J. Smith | David M. Stresser | Mitchell Taub | Michael Zientek | Bhagwat Prasad
转化与临床药理学系，2518 辛辛那提儿童医院医疗中心，辛辛那提，俄亥俄州 45229，美国
虽然细胞色素P450酶和UDP-葡萄糖醛酸转移酶在药物代谢中起主导作用，但水解酶正逐渐成为小分子以及抗体-药物结合物或肽-寡核苷酸结合物代谢的关键参与者。尽管水解酶非常重要，但它们在不同组织中的蛋白水平及其个体间的差异仍知之甚少。尽管靶向蛋白质组学能够在定量少量蛋白质时提供高选择性和精确度，但基于总蛋白（TPA）的蛋白质组学方法正成为多重蛋白质定量分析的更优选择。我们对靶向蛋白质组学和基于TPA的蛋白质组学方法进行了直接比较，以测定人肝和肠S9组分中的12种临床相关水解酶（每种约5个样本）。基于TPA的全局蛋白质组学方法具有更高的精确度（变异系数<20%）和相当的灵敏度，并且其更大的蛋白质覆盖范围是其固有的优势。TPA数据分析结果显示，目标蛋白在肝脏中的丰度顺序为：CES1 > EPHX1 > CES2 > BPHL > PON3 > PON1 ～ AADAC > CTSA > DPP4；在肠道中则为：CES2 > ADA > DPEP1 ～ AADAC ～ EPHX1 > ALPI > DPP4 > CTSA > BPHL ～ CES1。这项研究突显了基于TPA的全局蛋白质组学在表征水解酶在不同组织中的差异丰度及其个体间变异方面的实用性。
