通过Olink蛋白质组学和机器学习发现无症状结核病的生物标志物

《Journal of Rare Earths》:Discovering Biomarkers for Asymptomatic Tuberculosis via Olink Proteomics and Machine Learning

【字体: 时间:2025年10月25日 来源:Journal of Rare Earths 7.2

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  本研究通过整合Olink蛋白质组学技术与多种机器学习算法,鉴定并验证了EN-RAGE和MCP-3作为无症状结核病(asymptomatic TB)的生物标志物,其联合检测的AUC达0.90,独立验证队列中AUC为0.837,显著优于健康对照组和潜伏性结核感染(LTBI)。

  
孙庆峰|李珊珊|任伟聪|周游|姚聪|石柳春|刘爱梅|高梦秋|庞宇
首都医科大学耐药结核病研究北京市重点实验室细菌学与免疫学系,北京胸科医院117550,北京101149,中国
由于疾病处于早期阶段,无症状结核病(TB)的诊断仍然具有挑战性。本研究旨在通过整合Olink蛋白质组学技术与多种机器学习算法,识别并验证无症状TB的血浆生物标志物。使用Olink邻近扩展检测(Proximity Extension Assay)分析了血浆样本,该检测针对92种与炎症相关的蛋白质;支持向量机(SVM)、随机森林、神经网络和XGBoost算法被用于筛选和识别最具区分性的生物标志物。我们的数据显示,EN-RAGE和MCP-3在无症状TB病例中显著上调。EN-RAGE和MCP-3的组合能够准确区分无症状TB与健康对照组和潜伏性结核感染(LTBI),曲线下面积(AUC)为0.90(95%置信区间:0.85–0.95)。在独立队列中进行的ELISA验证证实,与健康对照组和LTBI相比,无症状TB患者的EN-RAGE和MCP-3水平显著升高(AUC = 0.837,95%置信区间:0.75–0.924,p < 0.05)。这些发现表明,EN-RAGE和MCP-3的组合在无症状TB的诊断中具有很高的潜力。进一步将EN-RAGE和MCP-3应用于临床实践可能有助于早期识别无症状TB,改善患者预后并增强结核病控制策略。
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