评估泛癌循环肿瘤DNA下一代测序技术在晚期癌症患者中的预后预测价值

《OncoTargets and Therapy》：Evaluating the Prognostic Value of a Pan-Cancer Circulating Tumor DNA Next-Generation Sequencing Panel in Advanced Cancer Patients

ctDNA动态监测可预测晚期实体瘤治疗反应及无进展生存期，基线检测85.4%患者存在TP53等基因突变，治疗后新发突变与预后不良显著相关（HR 4.87, P=0.0035）。纵向追踪显示清除ctDNA者预后更佳，验证了pan-cancer NGS面板在实时监测肿瘤演进中的临床价值。

　　本研究旨在评估一种覆盖多种癌症类型的循环肿瘤DNA（ctDNA）下一代测序（NGS）面板在预测晚期实体瘤患者治疗反应和无进展生存期（PFS）方面的临床价值。随着癌症治疗手段的不断进步，如何准确评估治疗效果和预测疾病进展成为临床决策中的重要环节。ctDNA作为非侵入性生物标志物，能够反映肿瘤的基因变化，并通过血液检测的方式实现动态监测。这种方法在癌症治疗监测中展现出巨大的潜力，尤其对于传统组织活检难以获取样本的肿瘤类型，其应用更为广泛。

研究纳入了41名患有晚期实体瘤的患者，其中包括胃癌、非小细胞肺癌、头颈癌、食管癌、乳腺癌和结直肠癌。研究团队对这些患者的ctDNA进行了三次检测，分别是在治疗前、治疗后评估以及随访阶段。通过这些时间点的ctDNA分析，研究人员希望了解其在治疗过程中和治疗后的变化趋势，并评估这些变化是否能够作为预测疾病进展的指标。

在治疗前的ctDNA检测中，35名患者（85.4%）显示出第一或第二级别的体细胞变异。其中，TP53基因是最常发生突变的基因，这一发现具有重要的临床意义。TP53基因突变在多种癌症中普遍存在，且通常与肿瘤的侵袭性和不良预后相关。此外，研究还发现，除了TP53之外，其他常见的变异基因包括PIK3CA、APC、ARID1A和ERBB2，这些基因在不同类型的癌症中也显示出较高的变异频率。值得注意的是，研究中还观察到一些患者在治疗前没有可检测的变异，但在治疗后或随访阶段出现了新的变异，这些变异通常与疾病进展相关。这一现象表明，即使在治疗前ctDNA检测结果为阴性的患者中，治疗后出现新的变异也可能预示着较差的临床结果。

在治疗后的评估中，研究人员对37名患者进行了ctDNA检测。结果显示，ctDNA阳性患者的无进展生存期明显短于阴性患者。通过Kaplan-Meier分析和Cox比例风险回归模型，研究团队发现，治疗后ctDNA阳性与较差的PFS存在显著相关性（HR 10.5，95% CI 1.4–80.0，P=0.024）。这一发现进一步支持了ctDNA作为动态监测工具的价值，因为它不仅能够反映治疗前的肿瘤状态，还能在治疗后提供关于疾病进展的实时信息。

在随访阶段，18名患者接受了ctDNA检测，其余19名患者因失访、研究期提前终止或快速恶化而无法进行检测。研究发现，其中9名患者在随访期间出现了疾病进展或死亡，而另外9名患者则显示出临床改善。在这些随访患者中，8人出现了新的ctDNA变异，其中2人是在治疗后检测中发现的，而6人是在随访阶段发现的。相比之下，仅有一名患者在治疗后和随访阶段均未检测到新的变异。此外，研究还发现，在随访阶段，疾病进展或死亡的患者其ctDNA变异频率（VAFmax）显著高于临床改善的患者，这一差异具有统计学意义（P=0.0272）。这表明，ctDNA的动态变化可能比单一时间点的检测更能准确预测疾病进展。

研究还探讨了ctDNA检测结果与临床结果之间的关联。在治疗后阶段，ctDNA阳性患者的PFS明显短于阴性患者，这进一步强调了ctDNA监测在治疗后评估中的重要性。同时，研究发现，即使在治疗前未检测到变异的患者中，治疗后出现新的变异也可能预示着较差的预后。这一结果对临床实践具有重要启示，因为它表明，ctDNA检测不仅仅局限于治疗前的评估，而是应该贯穿整个治疗过程，包括治疗后和随访阶段。

此外，研究还指出，ctDNA检测结果的准确性依赖于排除与遗传背景或慢性血液病（如克隆性造血，CHIP）相关的变异。在某些情况下，由于技术限制或肿瘤生物学特性，ctDNA检测可能会出现假阴性结果，即某些肿瘤即使存在变异，也可能因为ctDNA释放量较低而无法被检测到。因此，为了提高检测的特异性，研究团队对所有患者进行了外周血单核细胞（PBMC）DNA的平行检测，以区分真正的肿瘤来源变异和遗传背景变异。然而，由于样本量较小，该方法对变异分类的具体影响尚未得到量化评估，这为未来研究提供了方向。

在非小细胞肺癌（NSCLC）亚组中，尽管经典驱动基因（如EGFR）的变异较少，但ctDNA的动态变化仍然与临床结果密切相关。对于那些具有良好预后的患者，治疗后ctDNA负担显著下降，而那些出现疾病进展的患者则在随访阶段检测到新的变异。这一结果表明，ctDNA不仅在存在经典驱动基因变异的患者中具有预测价值，而且在缺乏这些变异的情况下，也能通过动态监测提供重要的预后信息。

研究团队还指出，ctDNA的动态监测具有潜在的临床应用价值。例如，通过检测治疗后新出现的变异，可以更早地识别高风险患者，并调整其随访频率或治疗方案。此外，持续的ctDNA阳性可能提示需要加强治疗或尝试其他治疗策略。同时，ctDNA的变化还可以用于筛选适合参加临床试验的患者，特别是那些正在接受新型靶向治疗或免疫治疗的患者。这些发现为未来将ctDNA监测纳入癌症治疗决策提供了理论依据和实践指导。

尽管研究结果具有重要意义，但研究团队也承认了一些局限性。首先，由于样本量较小，研究结果的统计学效力可能受到一定限制，特别是在不同癌症类型的亚组分析中。其次，患者的治疗方案存在差异，这可能对研究结果产生一定的干扰。此外，由于随访时间较短，研究未能系统评估整体生存期（OS），而OS是癌症预后评估的重要指标。因此，未来的研究需要在更大的样本量和更长的随访时间下进行，以进一步验证ctDNA动态变化与PFS或OS之间的关系。

综上所述，本研究通过纵向监测ctDNA的变化，揭示了其在晚期实体瘤患者治疗后评估和预后预测中的重要价值。ctDNA的动态变化，特别是治疗后新出现的变异，可能比治疗前的静态检测更能准确反映疾病的进展情况。然而，为了确保这一方法的广泛适用性和临床可靠性，需要进一步在更大规模的患者群体中进行验证，特别是在胃癌、肺癌、头颈癌和食管癌等癌症类型中。此外，研究还强调了提高检测灵敏度和建立标准化的分析流程对于临床实践的重要性，这些努力将有助于更全面地利用ctDNA作为非侵入性生物标志物，为癌症患者的个性化治疗提供支持。