树突状细胞DNMT1表观遗传重编程通过IL-12b/TIM4轴调控过敏性气道炎症中Th2偏移的新机制
《Cell Communication and Signaling》:Epigenetic reprogramming of dendritic cells by DNMT1 inhibition attenuates Th2 skewing in allergic airway inflammation
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时间:2025年10月26日
来源:Cell Communication and Signaling 8.9
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本研究针对过敏性哮喘中树突状细胞(DC)介导Th2极化的表观遗传机制不清问题,开展DNMT1抑制对DC表观遗传重编程的主题研究。发现DNMT1通过甲基化沉默IL-12b和稳定TIM4的双重机制驱动Th2偏移,DNMT1抑制剂5-azadC可逆转这一过程。该研究为哮喘的Th1/Th2免疫失衡提供了新的治疗靶点。
当过敏原侵入呼吸道时,我们的免疫系统如何做出反应?为什么有些人会发展为过敏性哮喘,而有些人却不会?这背后隐藏着复杂的免疫调控机制。过敏性哮喘作为一种慢性气道炎症性疾病,其特征是辅助性T细胞2(Th2)免疫应答异常,导致气道高反应性和炎症细胞浸润。在免疫系统中,树突状细胞(DC)作为关键的抗原呈递细胞,在调控Th1/Th2平衡中扮演着核心角色。然而,关于表观遗传调控特别是DNA甲基化如何影响DC功能并导致Th2偏斜的机制仍不清楚。
近年来,表观遗传学研究揭示了DNA甲基转移酶(DNMT)在免疫调控中的重要作用。DNA甲基化是通过在基因启动子区域的CpG岛添加甲基基团来沉默基因表达的表观遗传修饰方式。DNMT1作为主要的DNA甲基转移酶,在癌症和自身免疫疾病中已被广泛研究,但其在DC介导的过敏性炎症中的具体功能尚不明确。特别值得注意的是,白细胞介素12b(IL-12b)作为一种重要的Th1极化细胞因子,在哮喘患者中表达常常受到抑制,但其下调的表观遗传机制尚未阐明。同时,T细胞免疫球蛋白域分子4(TIM4)作为DC上的磷脂酰丝氨酸受体,能够增强Th2细胞的活化。在过敏性炎症中,TIM4表达上调,但其是否受到表观遗传调控以及与IL-12b之间的相互作用关系仍未知。
在这项发表于《Cell Communication and Signaling》的研究中,薛金梅等人深入探讨了DNMT1在DC中介导Th2极化的分子机制。研究人员提出假设:DC中的DNMT1通过双重机制维持Th2极化——一方面通过甲基化依赖性方式沉默Il12b基因,削弱Th1应答;另一方面通过稳定TIM4表达,而TIM4的稳定性受到IL-12b介导的泛素化调控。
为了验证这一假设,研究团队结合了屋尘螨(HDM)诱导的小鼠哮喘模型、DC特异性Dnmt1基因敲除(Dnmt1fl/fl Itgax-Cre)、药物性DNMT1抑制(5-氮杂-2'-脱氧胞苷,5-azadC)以及多种分子生物学技术,包括染色质免疫沉淀(ChIP)、实时荧光定量PCR(RT-qPCR)和泛素化分析,系统性地解析了DC中IL-12b和TIM4的甲基化依赖性调控机制。
主要实验技术包括:使用屋尘螨提取物(DME)诱导的小鼠过敏性哮喘模型、骨髓来源树突状细胞(BMDC)的分离和培养、酶联免疫吸附试验(ELISA)检测细胞因子、甲基化特异性定量PCR(MS-qPCR)分析Il12b启动子甲基化状态、流式细胞术进行免疫细胞分型和细胞内细胞因子染色、染色质免疫沉淀(ChIP)分析转录因子和组蛋白修饰结合、泛素化实验检测TIM4降解机制,以及DC与CD4+ T细胞共培养实验评估Th2极化能力。
研究团队成功建立了屋尘螨诱导的小鼠过敏性气道炎症模型。与对照组相比,致敏小鼠表现出明显的过敏性哮喘临床症状,气道高反应性增强,支气管肺泡灌洗液(BALF)中炎症细胞总数和Th2细胞因子(IL-4、IL-5、IL-13)水平显著升高,而Th1细胞因子(IFN-γ和TNF-α)水平降低。使用DNMT抑制剂5-azadC处理后,过敏症状评分、气道阻力和Th2细胞因子水平均显著降低,表明DNA甲基化在Th2极化中起关键作用。
抑制树突状细胞中甲基转移酶DNMT1可抑制气道过敏性炎症
通过DC特异性Dnmt1基因敲除(KO)小鼠模型,研究人员发现,与对照(cKO)小鼠相比,Dnmt1缺失显著减轻了DME诱导的气道炎症,表现为支气管周围炎症细胞浸润减少,BALF中嗜酸性粒细胞计数、嗜酸性粒细胞过氧化物酶(EPX)、肥大细胞蛋白酶-1(Mcpt1)和Th2细胞因子水平均显著下降。组织学分析进一步证实KO小鼠肺部炎症和黏液产生减少。这些结果表明,遗传和药物抑制DC中的DNMT1均可减轻过敏性炎症,突出了DC特异性甲基化作为治疗靶点的潜力。
DNA甲基化抑制逆转致敏诱导的树突状细胞中IL-12b产生的抑制
从过敏性哮喘(AA)小鼠肺部分离的单个核细胞中,IL-12b+ DC的比例显著降低,而IL-12a+ DC比例无变化。5-azadC处理可恢复AA小鼠中IL-12b+ DC的频率至正常水平。纯化的DC中,AA小鼠来源的DC显示IL-12b mRNA表达降低74%,经5-azadC处理后恢复正常。这些结果表明,致敏通过甲基化机制特异性抑制DC中IL-12b的表达,而DNMT1抑制可逆转这一效应。
DNA甲基化抑制恢复致敏诱导的树突状细胞Il12b启动子表观遗传失调
AA小鼠来源的DC中,转录因子PU.1与Il12b启动子的结合减少,而c-Rel结合无变化。5-azadC处理可恢复PU.1的结合。Il12b启动子区域显示DNA甲基化水平增加1.8倍,组蛋白修饰H3K4me3富集增加4.7倍。5-azadC处理使启动子甲基化降低57%,H3K4me3富集降低84%,并恢复RNA聚合酶II(Pol II)结合,使Il12b mRNA和蛋白表达恢复正常。这些结果表明,5-azadC可正常化Il12b启动子的甲基化和组蛋白修饰,挽救PU.1结合和转录活性。
致敏诱导的树突状细胞TIM4上调和IL-12b抑制驱动Th2极化
AA小鼠气道DC中TIM4 mRNA和蛋白表达上调。DME刺激的BMDC显示TIM4表达呈剂量依赖性上调,而IL-12b表达受抑制。脂多糖(LPS)共处理可减弱DME诱导的TIM4上调并恢复IL-12b表达。Il12b-/- BMDC即使经DME和LPS处理,仍保留诱导Th2极化的能力(IL-4增加7.3倍)。这些发现表明,DME诱导的DC中TIM4上调和IL-12b抑制共同驱动Th2极化,而TLR4激活可对抗这一效应。
DNA甲基化抑制通过IL-12b介导的泛素化和DNMT1-TIM4轴减弱致敏气道树突状细胞中TIM4的产生
AA DC中DNMT1在Il12b启动子的占据增加7.3倍,且与TIM4表达水平正相关。DME刺激的BMDC中DNMT1结合增加10.9倍,TIM4表达上调4.9倍,而5-azadC处理可抑制TIM4上调。IL-12b通过Trim28介导的K48连接泛素化促进TIM4降解,蛋白酶体抑制剂MG132可阻断此过程。Timd4敲低破坏了DNMT1在Il12b启动子的招募,而LPS处理可恢复PU.1-STAT6转录复合物形成。这些结果揭示了一个反馈回路:TIM4维持DNMT1驱动的Il12b高甲基化,而IL-12b通过泛素化 destabilizes TIM4,减轻Th2极化。
本研究系统阐明了DC中DNMT1通过表观遗传和翻译后机制调控Th2极化的新通路。DNMT1介导的Il12b启动子高甲基化导致IL-12b表达沉默,同时TIM4表达上调,二者共同促进Th2偏斜。重要的是,研究发现IL-12b可通过促进TIM4的泛素化降解而负反馈调节TIM4表达,形成自我限制回路。DNMT1抑制剂5-azadC可破坏这一回路,恢复免疫平衡。
这一发现不仅深化了对过敏性哮喘发病机制的理解,也为治疗干预提供了新靶点。靶向DNMT1和TIM4可能成为恢复哮喘患者Th1/Th2平衡的新策略,特别是对于对皮质类固醇或生物制剂耐药的Th2高内型患者。此外,研究揭示了DNA甲基化与组蛋白修饰在调控免疫基因表达中的复杂相互作用,即使存在激活性的组蛋白标记(H3K4me3),DNA甲基化仍可主导基因沉默,这一现象在过敏炎症中此前未被充分认识。
研究的局限性包括5-azadC作为广谱DNMT抑制剂可能靶向多种细胞类型,以及需要进一步在人类DC和临床队列中验证这些发现。未来研究应探索DNMT1与其他表观遗传调控因子(如TET酶)在DC中的相互作用,以及IL-12b在非DC细胞类型中的作用。
总之,这项研究揭示了DC中DNMT1-IL-12b-TIM4轴在过敏性哮喘Th2极化中的核心作用,为开发表观遗传疗法补充现有哮喘治疗策略提供了理论依据,强调了针对特定表观遗传靶点重新编程免疫细胞功能的治疗潜力。
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