津巴布韦狂犬病病毒遗传多样性解析：AF1b亚系主导流行与AF3谱系跨物种传播

《Discover Viruses》：Genetic diversity of rabies virus in Zimbabwe

本研究针对津巴布韦狂犬病病毒（RABV）遗传多样性数据匮乏的现状，通过对2014–2020年采集的74份家养与野生动物脑样本进行系统发育分析，揭示非洲1b亚系（AF1b）为当地主要流行株，并首次发现非洲3谱系（AF3）在犬与猫鼬间的跨物种传播。该研究为优化区域狂犬病防控策略提供了关键分子流行病学依据，对推动“One Health”干预具有重要意义。

　　

狂犬病是一种由狂犬病病毒（Rabies virus, RABV）引起的高度致死性脑脊髓炎，全球每年数万人因此丧生，其中非洲地区负担尤重。在津巴布韦，狂犬病长期流行，每年报告约450例人类死亡病例，但病毒在当地家养动物与野生动物中的遗传多样性和传播动态始终缺乏系统研究。历史上，津巴布韦曾通过大规模犬只扑杀暂时控制疫情，但1950年后病毒再次传入并形成地方性流行。值得注意的是，黑背胡狼等野生动物被视为次要传播宿主，而猫鼬相关毒株（AF3谱系）的潜在威胁亦未明确。这一知识缺口严重制约了基于病毒分子特征的精准防控策略制定。

为填补这一空白，Lambert Gwenhure Fadzai等人在《Discover Viruses》发表研究，对2014至2020年间津巴布韦兽医部门收集的74份动物脑样本（包括50份家养动物和24份野生动物样本）展开多维度分析。通过直接免疫荧光试验（DFAT）、靶向L基因与N基因的RT-PCR、系统发育分析及近全长基因组测序，团队全面揭示了当地RABV的遗传演化格局。

研究主要技术方法包括：利用DFAT和RT-PCR进行病毒检测；通过CYTB基因测序验证宿主物种；基于最大似然法（Maximum Likelihood, ML）构建L基因与N基因系统发育树；结合二代测序（NGS）获取代表毒株近全长基因组。样本覆盖犬、猫、牛等家养动物及胡狼、猫鼬、蜜獾等野生动物，地理范围涉及哈拉雷、布拉瓦约等城乡区域及万基国家公园等野生动物保护区。

3.1 样本收集

研究共纳入74份样本，家养动物占比67.6%（50/74），以犬（27份）和牛（15份）为主；野生动物中以胡狼（14份）和猫鼬（2份）为代表。样本时间分布显示2017年为提交高峰（18份），空间上家养动物病例集中于哈拉雷及布拉瓦约周边，野生动物病例则多见于万基国家公园所在区域。

3.2 狂犬病诊断和分子分析

DFAT检测阳性率为94.6%（70/74），而L基因与N基因RT-PCR阳性率分别为79.7%（59/74）和37.8%（28/74）。两种PCR联合检测共62份样本阳性，其中2份DFAT阴性样本（来自羚羊和猫鼬）经PCR复核为阳性，提示分子检测对降解样本更具灵敏度。

3.3 系统发育分析

基于部分L基因（250 bp）的系统发育分析显示，59份阳性样本中除2份外均属于AF1b亚系（Cosmopolitan分支）。另2份样本（DVS-19犬和DVS-26猫鼬）聚类于AF3谱系。

全长N基因（1350 nt）分析进一步证实AF1b可划分为两个亚群（SC1与SC2），二者在物种与地理分布上无显著差异，且与南非、莫桑比克等邻国历史毒株亲缘相近。AF3毒株与1994年津巴布韦Rusape市猫鼬分离株及2001年南非猫源毒株高度同源。

研究还成功获取AF1b代表毒株DVSIDB66（11558 nt）和AF3代表毒株DVSIDB26（11828 nt）的近全长基因组，基于L蛋白的全序列系统发育分析再次验证上述分型结果。

4 讨论

本研究首次系统揭示津巴布韦RABV流行以AF1b为主导，且存在SC1与SC2共循环格局，凸显病毒在南部非洲的跨区域传播动态。AF3谱系在犬中的检出（DVS-19）证实其可突破猫鼬宿主限制，引发“溢出感染”，对野生动物保护与公共卫生构成双重威胁。尽管家犬仍是主要传播源，但野生动物（尤其是胡狼）作为次要储存宿主的角色不可忽视，而低犬类疫苗接种覆盖率（远低于70%目标）仍是疫情控制的核心障碍。

5 结论

津巴布韦狂犬病流行呈现AF1b与AF3双谱系共循环的复杂态势，且病毒在家养与野生动物间广泛传播。研究强调应通过“One Health”策略加强监测、提升犬类免疫覆盖率，并优化实验室诊断流程（如联合DFAT与PCR）。这些发现为南部非洲狂犬病根除计划提供了关键分子依据，对降低人畜共患风险及保护濒危物种具有深远意义。