脱氮微球菌：一种从陆地泥火山分离的具有苯甲酸降解能力的兼性厌氧新菌株

《Synthetic and Systems Biotechnology》：Denitraticella aggregata gen. nov., sp. nov. a denitrifying benzoate-utilizing bacterium isolated from a terrestrial mud volcano

本研究报道了一株从俄罗斯塔曼半岛Karabetova Gora泥火山分离的新菌株SMB388T。该菌为兼性厌氧、兼性化能自养，能以苯甲酸为碳源进行反硝化作用（denitrification）。其最适生长条件为30°C、pH 8.0、NaCl浓度2.0–2.5%。基因组分析（G + C含量64.4 mol%）支持其归属于Zoogloeaceae科的新属新种，命名为Denitraticella aggregata gen. nov., sp. nov.，为氮循环和芳香化合物降解研究提供了新的微生物资源。

　　

Section snippets

Origin of the strain

菌株SMB388^T分离自2018年9月从俄罗斯塔曼半岛陆地泥火山Karabetova Gora的salsa湖采集的沉积物和水样。采样点坐标为北纬45.202°，东经36.783°。样品取自水面下20–30厘米深处，装入带橡胶塞和螺旋盖的无菌玻璃瓶中运输至实验室，以尽量减少氧气存在。采样时使用数字pH计测量了样品的温度和pH值。

Pure culture isolation and cell morphology

通过将10% (w/v)的泥浆接种到含有苯甲酸（5 mM）作为电子供体、硝酸盐（10 mM）作为电子受体的无菌厌氧培养基中，启动了富集培养。在30°C黑暗条件下培养10–14天后，观察到杆状细胞生长。经过三次后续传代培养，并在同一培养基中进行系列10倍稀释后，在最高生长阳性稀释度中仅观察到一种形态类型。由此获得的纯培养物被指定为菌株SMB388^T。

Discussion

系统发育分析表明，菌株SMB388^T代表了Zoogloeaceae科一个新属的新种，与‘A. taiwanensis’和‘P. pumilus’亲缘关系最近。Zoogloeaceae科最初由Boden等人（2017）基于16S rRNA基因系统发育学提出。最近，Huang等人（2021）利用GTDB工具基于全基因组序列重新审视了Zoogloeaceae科的系统发育。目前（2025年8月），Zoogloeaceae科包含12个属。