Nocardiopsis dassonvillei来源的PHB解聚酶的异源表达、生化特性及分子对接研究

《Epilepsy & Behavior Reports》：Overexpression, biochemical characterization, and structural modeling of polyhydroxybutyrate depolymerase from Nocardiopsis dassonvillei

本研究首次实现了Nocardiopsis dassonvillei来源的PHB解聚酶（PHBD）的体外密码子优化合成，并在大肠杆菌中成功表达。通过Ni-NTA亲和层析纯化获得约50 kDa的重组酶，其最适温度为35℃、最适pH为8.0。分子对接揭示了疏水氨基酸在催化位点的重要作用，该酶能有效降解PHB和PHBVH薄膜，为生物塑料废弃物管理提供了新策略。

　　

¹研究亮点¹

PHBD的基因组学观察

最近研究发现N. dassonvillei NCIM 5124具有降解PHB的能力。通过NCBI中获得的完整基因组，鉴定出负责PHB降解的酶序列。为阐明N. dassonvillei来源PHBD的进化史，我们与其他微生物的PHBD共同构建了系统发育树（图1）。树底部的比例尺表示氨基酸替换次数，分支长度则显示...

密码子优化及在大肠杆菌BL21(DE3)中的过表达

与N. dassonvillei NCIM 5124相关的PHBD基因（GenBank登录号MCK9871921.1）通过专利Optimum...

²结论²

热带海洋分离株N. dassonvillei近期被发现具有降解PHB的能力。系统发育树显示其PHBD与Nocardiopsis属的PHBD亲缘关系最近。该PHBD基因在大肠杆菌BL21(DE3)中成功过表达。虽然重组酶能被0.5 mM IPTG有效诱导，但未实现胞外分泌。通过亲和层析完成重组PHBD的纯化。SDS-PAGE...