基于天然低共熔溶剂的尿酸氧化酶稳定性与催化效率提升研究:多尺度实验与模拟策略
《Journal of Molecular Liquids》:Improving the stability and catalytic efficiency of urate oxidase with natural deep eutectic solvents: Integrated in vitro and in silico approaches
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时间:2025年10月27日
来源:Journal of Molecular Liquids 5.2
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本研究通过天然低共熔溶剂(DES)显著提升黄曲霉尿酸氧化酶(UOX)的热稳定性(Tm↑)与催化效率(Kcat↑),结合荧光光谱与分子动力学模拟揭示DES诱导酶结构紧缩的分子机制,为酶制剂工业化应用提供新策略。
本研究创新性地采用由海藻糖、甘油和氯化胆碱构成的天然低共熔溶剂(DES)处理尿酸氧化酶(UOX),通过多尺度实验与模拟验证其显著提升酶热稳定性(Tm↑)与催化效率(Kcat↑)的分子机制。
实验所用试剂包括8-苯胺基-1-萘磺酸(ANS)、硼酸、尿酸(≥99%纯度)等购自Sigma-Aldrich;碘化钾、氯化胆碱、海藻糖(≥99%纯度)等由Merck提供;Ni-NTA亲和层析树脂购自Qiagen。
近年来荧光光谱技术的灵敏度、空间分辨率和稳健性显著提升。本研究使用Cary Eclipse荧光光谱仪对比分析DES处理前后UOX的稳态荧光变化,通过碘化钾荧光淬灭实验、ANS结合实验及内源荧光检测,发现DES使酶结构更紧凑并维持天然构象。
基于尿酸氧化酶晶体结构(PDB ID: 5FRC),采用GROMACS 2024软件包与CHARMM27力场进行分子动力学模拟。DES组分的拓扑参数通过SwissParam生成,体系经最速下降法能量优化后,分析RMSF(均方根涨落)、RMSD(均方根偏差)、SASA(溶剂可及表面积)、RG(回转半径)等参数,证实DES处理使酶整体能量降低、结构更稳定。
实验采用携带pET-28a质粒的重组大肠杆菌(BL21/DE3),通过卡那霉素抗性筛选阳性克隆(图1A)。酶纯化采用镍离子亲和层析技术,最终获得高纯度UOX用于后续实验。
DES-TCG处理显著增强UOX的热稳定性和催化性能。DSC和FTIR验证了DES的共晶特性,荧光与分子动力学模拟一致表明DES通过诱导酶结构紧缩提升稳定性,为工业酶制剂开发提供新思路。
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