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设计、合成及评估肌醇依赖性酶1型(IRE1α)抑制剂在细胞内的活性
《ACS Medicinal Chemistry Letters》:Design, Synthesis, and Cellular Efficacy of Inositol-Requiring Enzyme Type 1 (IRE1α) Inhibitors
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年10月27日 来源:ACS Medicinal Chemistry Letters 4.0
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本研究通过分子对接设计并制备了66个靶向IRE1α的小分子,采用3×3 DoE结合HTE优化Suzuki偶联反应,筛选出14个潜在抑制剂,其中6个IC50与标准药KIRA6相当,3个更优,细胞毒性测试表明最佳抑制剂在有效浓度下不致命且优于KIRA6。

我们采用分子对接方法设计了一组共66种针对IRE1α的小分子,并通过两步反应序列使用多种底物制备了这些化合物。所有化合物均以1-氨基-4-溴萘为核心结构,通过铃木偶联反应与硼酸反应生成中间体,随后进一步通过氨基甲酰化作用得到尿素连接的抑制剂候选物。我们开发了一种基于3^3组合实验设计(3^3 DoE)的方法来优化铃木偶联反应,通过216次实验进行了优化。通过将纯化的化合物在Tunicamycin诱导的ER应激模型中与ARPE-19细胞进行检测,并利用RT-qPCR技术量化其激酶抑制活性,我们发现了14种具有IRE1α抑制潜力的衍生物。IC50测定结果显示,其中有6种化合物的抑制效果与IRE1α抑制的标准试剂KIRA6相当,其中3种化合物的IC50值更优。生存率测试表明,这些最佳的IRE1α抑制剂在工作浓度下不具有细胞毒性,并且与KIRA6相比能够更好地抑制细胞凋亡。
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