犀科动物的进化史：系统发育见解、气候影响及保护意义

《Cladistics》：The evolutionary history of Rhinocerotidae: phylogenetic insights, climate influences and conservation implications

家族犀科的系统发育通过整合形态学、分子生物学、化石和古气候数据，在最大简约性、最大似然性、贝叶斯框架和时间校正框架下进行总证据分析。采用106个物种和534个形态特征（含11新定义特征）的系统修订，使用化石为外群选择优化特征极性。研究揭示了气候变化对物种分化和特征保留的调控作用，为古生物学和系统发育方法论提供了新模型。

　　

摘要

犀科（Rhinoceroidae）的系统发育关系复杂且存在争议，其化石记录可追溯至5000多万年前。本研究对犀科进行了迄今为止最全面的系统发育分析，整合了形态学、分子生物学、化石学和古气候学数据，采用了最大简约法（maximum parsimony）、最大似然法（maximum likelihood）、贝叶斯方法（Bayesian）和时间校准（time-calibration）等分析框架。通过系统地重新定义一些先前存在争议的形态特征，构建了一个包含106个分类单元和534个形态特征的矩阵（其中11个特征是新定义的）。与早期研究不同，本研究选择以已灭绝的动物作为外群（outgroup），而非现存的貘类（Tapirus），以改善特征极性的判断并减少因选择远缘外群而产生的拓扑伪影。所得到的系统发育树解决了犀科分类学中的长期争议，并确认了许多得到支持的演化支系。对这些演化支系的分析表明，物种分化与某些气候阈值之间存在关联，这些气候阈值似乎影响了生态系统的更替以及某些特征的持续存在。这种综合性的全证据分析方法（integrated total-evidence approach）揭示了气候和生态因素在塑造大型动物演化轨迹中的作用，也为系统发育学中的方法论讨论提供了重要启示。所开发的分析框架适用于已灭绝和现存物种，进一步证明了严谨的支序学方法在古生物学和系统学研究中的价值。

利益冲突

作者声明没有利益冲突。