微波合成异戊烯化芦丁衍生物的抗癌活性:计算机模拟与体外研究的整合分析

【字体: 时间:2025年10月28日 来源:Results in Chemistry 4.2

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  本研究针对天然异戊烯化黄酮类化合物来源有限的问题,开发了一种高效的微波辅助合成方法,成功制备了三种新型异戊烯化芦丁衍生物。体外实验表明,化合物(1)和(3)对HCC1954癌细胞株显示出显著抑制活性(IC50分别为4.76 μM和7.58 μM),且化合物(1)还表现出强抗氧化能力(ABTS•+实验IC50=9.38 μM)。分子对接与动力学模拟揭示了其与1T8I酶(人拓扑异构酶I)的稳定结合模式,为开发新型抗癌先导化合物提供了重要依据。

  
在天然产物药物研发领域,异戊烯化黄酮类化合物因其广泛的药理活性而备受关注。这类化合物通过在黄酮骨架上引入疏水性异戊烯基,显著增强了其膜亲和性和细胞摄取能力,从而改善生物利用度。然而,天然来源的异戊烯化黄酮,如8-异戊烯基槲皮素(8-PQ),在植物中含量极低,严重限制了其药理学研究和临床应用。传统的化学合成方法又往往面临步骤繁琐、产率低、区域选择性差等挑战。因此,开发高效、绿色的合成策略,快速获取结构多样的异戊烯化黄酮衍生物,并系统评价其生物活性,对于推动该类化合物的药物开发具有重要意义。
为了解决上述问题,越南胡志明市工业大学化学工程系的Van Son Nguyen等研究人员在《Results in Chemistry》上发表了一项整合性研究。他们以廉价易得的芦丁为起始原料,发展了一条简洁高效的微波辅助合成路线,成功制备了三种新型异戊烯化黄酮衍生物:3,5,7,3′,4′-五羟基-6-(2-甲基丁-3-烯-2-基)黄烷醇(1)、3,7,3′,4′-四甲氧基-8-异戊烯基黄烷醇(2)和8-异戊烯基槲皮素(3)。研究不仅评估了这些化合物的体外抗癌活性和抗氧化潜力,还利用计算机模拟技术深入探讨了其与抗癌靶标人拓扑异构酶I (1T8I)的相互作用机制,为基于异戊烯化黄酮的先导化合物优化提供了坚实的实验和理论依据。
为开展此项研究,研究人员主要应用了以下几项关键技术:微波辅助有机合成技术用于关键步骤(如糖苷键水解、Claisen重排)以提升效率和选择性;现代波谱分析技术(核磁共振NMR、质谱MS)用于精确鉴定合成化合物的结构;体外细胞模型评价技术(CCK-8法)用于测定化合物对HeLa、HCC1954和LC三种人癌细胞的细胞毒性;体外抗氧化活性评价技术(ABTS自由基清除实验);计算机辅助药物设计技术(包括分子对接、分子动力学MD模拟以及ADMET性质预测)。
3.1. 化学合成
研究人员设计并优化了从芦丁到目标化合物(1)和(3)的五步合成路线,以及到化合物(2)的三步合成路线。关键步骤在于利用微波辐射促进的Claisen重排反应,成功地将5位-O-异戊烯基黄烷醇转化为8位-C-异戊烯基黄烷醇。与传统加热方法相比,微波辅助合成将反应时间从72小时大幅缩短至45分钟,反应速率提高了约96倍,并且显著提高了反应的区域选择性和产物收率(最终总收率在8%至25%之间)。所有合成化合物的结构均通过1H NMR、13C NMR和质谱数据得到了确证。
3.2. 生物活性筛选
细胞毒性实验(CCK-8法)结果显示,所合成的三个异戊烯化黄酮化合物均对测试的癌细胞株表现出中等至显著的抑制活性。特别值得注意的是,化合物(1)和(3)对HCC1954细胞显示出优异的抑制效果,其IC50值分别为4.76 μM和7.58 μM,优于阳性对照药物顺铂(IC50=21.27 μM)。化合物(1)和(2)对LC细胞也表现出较强的活性(IC50分别为15.97 μM和16.55 μM)。在抗氧化活性方面,ABTS•+自由基清除实验表明,化合物(1)具有最强的抗氧化能力(IC50=9.38 μM),其活性接近标准抗氧化剂Trolox(IC50=6.16 μM)。这些结果提示,黄酮骨架上的游离酚羟基对其抗氧化活性至关重要,而异戊烯基的引入则显著增强了其抗癌细胞增殖的活性。
3.3. 分子对接模型
为了在分子水平上理解化合物的作用机制,研究人员进行了分子对接研究。他们选择与多种抗癌药物作用靶点相关的人拓扑异构酶I (1T8I)作为研究对象。对接结果显示,化合物(1)的最优构象(pose 276)与1T8I酶结合良好,结合自由能(ΔG)为-6.6 kcal·mol-1,抑制常数(Ki)为14.51 μM。分析发现,pose 276与1T8I活性位点的多个氨基酸残基(如Arg 488、Lys 532、Asp 533、Asn 631、Gln 633等)形成了6个氢键,同时还存在π-π堆积、π-烷基等多种相互作用,表明其与靶标蛋白形成了稳定的复合物。化合物(2)和(3)的最优构象也显示出与1T8I的良好结合能力。作为对比,已知的1T8I抑制剂喜树碱(camptothecin)的对接结果显示出更低的结合自由能(-8.51 kcal·mol-1)和抑制常数(0.575 μM),但其结合模式不同,主要依赖疏水相互作用而非氢键。
3.3.5. 对接模型的验证
为了验证对接结果的可靠性,研究人员计算了不同化合物最优构象之间的均方根偏差(RMSD)。结果表明,化合物(1)的pose 276与化合物(3)的pose 45可以较好地叠合(RMSD=1.618 ? < 2.0 ?),说明它们的结合模式相似。而pose 276与pose 283(化合物(2))以及pose 10(喜树碱)的RMSD较大,表明它们的结合模式存在差异。这初步证明了对接模型具有一定的合理性。
3.3.6. 分子动力学模拟
为了进一步评估化合物(1)与1T8I酶复合物在模拟生理环境下的稳定性,研究人员进行了为期100纳秒的分子动力学(MD)模拟。模拟结果显示,在整个模拟时间内,配体(pose 276)自身的构象波动较小(RMSD值在1-1.5 ?之间变化),验证了对接实验中获得的结合构象是稳定的。虽然配体-蛋白复合物的整体RMSD在40-60 ns时间段内出现了一些波动,但在0-40 ns和60-100 ns时间段内保持稳定。此外,分析氢键数量、回转半径(Rg)、溶剂可及表面积(SASA)等参数也表明,复合物在大部分模拟时间内保持了稳定的结合状态。这些MD模拟结果有力地支持了分子对接的预测,表明化合物(1)确实可以与1T8I酶形成稳定的相互作用。
3.4. 药代动力学-ADMET模型预测
利用ADMETlab 2.0平台对先导化合物(1)的类药性和药代动力学性质进行了计算机预测。结果表明,化合物(1)在吸收、分布、代谢、排泄和毒性(ADMET)方面大多表现出良好的性质。例如,其预测的人肠道吸收(HIA)较好,血脑屏障(BBB)穿透性较低,对主要细胞色素P450酶(CYP1A2, 2C9, 2C19, 2D6, 3A4)的抑制风险较低。需要注意的是,其预测的血浆蛋白结合率(PPB)较高(94.4%),半衰期(T1/2)较短(0.904小时),这可能在后续优化中需要关注。总体而言,ADMET预测结果显示化合物(1)具有成为候选药物的潜力。
4. 结论
本研究成功建立了一条高效、绿色的微波辅助合成路线,用于制备具有潜在抗癌活性的异戊烯化黄酮衍生物。生物学评价证实化合物(1)和(3)对HCC1954癌细胞具有显著的选择性抑制活性,同时化合物(1)还表现出强效的抗氧化能力。计算机模拟研究从分子层面揭示了这些化合物与抗癌靶标人拓扑异构酶I (1T8I)的相互作用机制,并预测先导化合物(1)具有良好的药代动力学性质。该工作不仅为获取稀缺的异戊烯化黄酮提供了实用的合成方法,而且通过实验与理论相结合的策略,深入探讨了其生物活性和作用机制,为基于天然产物结构的新型抗癌药物的研发提供了有价值的先导化合物和科学依据。未来的研究可以围绕对先导化合物进行结构优化以改善其溶解性、代谢稳定性,并开展更深入的体内药效学和安全性评价。
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