综述:KRAS突变癌症中直接与间接靶向KRAS的蛋白降解剂研究进展
《Biomedicine & Pharmacotherapy》:Research progress of direct and indirect KRAS-targeting protein degraders in KRAS-mutant cancers
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时间:2025年10月28日
来源:Biomedicine & Pharmacotherapy 7.5
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本综述系统梳理了针对“不可成药”靶点KRAS的蛋白降解技术(PROTAC)最新突破。文章重点阐述了直接靶向KRAS突变体(如G12C、G12D)及泛KRAS降解剂的开发进展,并延伸探讨了通过降解上游(如SOS1)或下游(如FAK、AKT)调控蛋白间接抑制KRAS通路的策略,为克服KRAS小分子抑制剂耐药提供了新方向。
RAS基因是最常被激活的原癌基因,属于GTP酶家族,其主要生理功能是调节细胞增殖。RAS基因的主要成员包括H-RAS、K-RAS和N-RAS。约16%的人类癌症与RAS蛋白相关,其中KRAS是最常见的癌基因。约17%的实体瘤存在KRAS突变,分别占结直肠癌、胰腺癌和肺腺癌的约50%、80%和25%。目前,针对KRAS突变体的小分子抑制剂研发已取得显著进展,但该领域研究仍十分活跃。近年来,随着靶向蛋白降解(TPD)技术的快速发展,针对KRAS的蛋白降解靶向嵌合体(PROTAC)研究相继涌现,这为解决KRAS小分子抑制剂耐药问题提供了新途径。本综述总结了KRAS靶向PROTAC开发的最新进展,重点关注直接靶向KRAS的降解剂(包括直接结合KRAS突变变体如G12C、G12D的降解剂和泛KRAS降解剂),并延伸讨论间接靶向KRAS的降解剂(通过靶向KRAS通路上游/下游调控蛋白如SOS1、FAK、AKT来调节其信号活性或蛋白稳定性)。
RAS家族(KRAS, NRAS, HRAS)是人类癌症中最常发生突变的基因家族,其中KRAS是主要亚型(占RAS突变的86%)。KRAS有四个结构域,但其功能主要依赖于G结构域和HVR(高变区)。G结构域具有保守的GTP结合口袋,作为KRAS的分子开关:GTP结合诱导活性状态(用于下游效应子相互作用),而GDP结合诱导非活性状态。大多数致癌RAS突变是G结构域热点(G12, G13, Q61)错义突变,这些突变会损害GTP酶活性,并将KRAS锁定在组成型活性状态,从而驱动肿瘤发生。C末端的HVR不参与GTP结合/水解,但确保KRAS的细胞内定位,通过变构调节G结构域活性,并结合膜磷脂/效应子,是一个关键的调控模块。
KRAS的细胞内运输和膜锚定受翻译后修饰调控:法尼基化(由FTase催化,通过C末端CAAX基序)使KRAS能够从细胞质转运至质膜;棕榈酰化(KRAS4A HVR)增强膜亲和力,而KRAS4B利用HVR-磷脂静电相互作用进行辅助锚定。修饰失调会将KRAS困在细胞质中,废除其信号传导功能。
临床上,KRAS点突变发生在14.3%的肿瘤中(胰腺导管腺癌76.5%,结直肠癌42.9%,肺腺癌27.4%)。KRAS独特的构象使其长期被视为“不可成药”靶点;其突变(与吸烟相关)与不良预后相关,凸显了KRAS靶向治疗的价值。
在正常生理条件下,EGFR/HER2经历配体诱导的二聚化和自身磷酸化,从而激活下游分子。KRAS活性是核苷酸依赖性的:GDP结合(非活性)与GTP结合(活性,启动信号级联)。激活的KRAS驱动关键的下游通路,其失调促进肿瘤发生。丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)通路对于转导涉及细胞生长、分化和应激的细胞外信号至关重要。通过顺序磷酸化,它调节多种转录因子,从而调控细胞增殖和生存所必需的基因表达。
磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)通路在KRAS下游被激活,通过PI3K催化的反应驱动细胞膜生成磷脂酰肌醇(3,4,5)-三磷酸(PIP3)。PIP3作为一个关键的对接支架,招募信号蛋白(特别是Akt);PI3K介导的Akt激活通过磷酸化下游底物来调节细胞代谢、生存和生长。Ral鸟嘌呤核苷酸交换因子(Ral-GEFs)通路是另一个KRAS激活的级联反应,调控细胞粘附、迁移和囊泡运输。Ral-GEFs促进Ral蛋白上的GDP/GTP交换以触发其激活,进而调控这些过程的关键效应子。总的来说,MAPK、PI3K和Ral-GEFs通路协调细胞过程并维持稳态。它们的失调(通常由异常的KRAS激活引起)与疾病(尤其是癌症)密切相关,导致不受控制的增殖、凋亡逃逸和细胞因子水平升高,从而促进炎症和肿瘤进展。
Research progress of KRAS-targeted protein degraders
在癌症研究领域,针对KRAS的靶向蛋白降解剂的探索已逐渐兴起并取得一定进展。然而,由于KRAS独特且复杂的结构特征,例如缺乏明显的小分子结合口袋和其高度动态的构象,设计能够直接和特异性作用于KRAS的小分子抑制剂面临着显著障碍,正如先前研究反复证明的那样。
鉴于KRAS直接靶向的挑战,间接策略提供了有前景的替代方案。这些策略不直接结合KRAS蛋白,而是通过靶向其通路中的关键调控节点来影响KRAS的信号输出或稳定性。例如,靶向SOS1(Son of Sevenless 1,KRAS的上游鸟嘌呤核苷酸交换因子)的降解剂可以抑制KRAS的GDP/GTP循环,从而将其锁定在非活性状态。同样,降解下游效应子如FAK(Focal Adhesion Kinase)或AKT可以切断KRAS驱动的促生存和增殖信号,达到抑制肿瘤的效果。
另一方面,直接靶向KRAS的PROTAC降解剂代表了更前沿的尝试。这些分子通常包含一个与KRAS突变体(如G12C或G12D)特异性结合的小分子配体,以及一个招募E3泛素连接酶的配体,通过泛素-蛋白酶体系统诱导KRAS蛋白的降解。其中,针对KRASG12C的降解剂已经显示出克服KRASG12C抑制剂耐药的潜力。此外,泛KRAS降解剂旨在降解多种KRAS突变体甚至野生型KRAS,为治疗具有不同KRAS突变背景的肿瘤提供了更广泛的治疗策略。
本综述深入探讨了针对癌症核心致癌驱动因子KRAS的靶向蛋白降解剂(PROTAC)开发的最新进展。KRAS基因在相当大比例的恶性肿瘤中发生突变,在肿瘤发生、疾病进展和治疗耐药中起着关键作用。虽然针对特定KRAS突变体(尤其是KRASG12C)的小分子抑制剂已取得一定的临床成功,但耐药性的出现仍然是主要挑战。靶向蛋白降解技术通过直接或间接方式清除KRAS蛋白或其关键调控因子,为克服耐药性和实现更持久、更深层次的肿瘤抑制提供了新的希望。未来的研究将集中于优化降解剂的效力、选择性和药物特性,并探索其在联合疗法中的应用潜力,以期最终为KRAS突变癌症患者带来新的治疗选择。
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