基于骨骼肌细胞与肌内脂肪细胞共培养模型的ceRNA网络调控牛肌内脂肪沉积机制研究

《Gene》：Critical lncRNA screening and ceRNA network Construction in bovine skeletal muscle cells and intramuscular adipocytes co-culture model

本研究通过牛骨骼肌细胞与肌内脂肪细胞Transwell共培养模型，利用RNA测序技术筛选出99个差异表达lncRNAs，构建了包含260个潜在相互作用的ceRNA调控网络，其中20个高置信度相互作用涉及8个DE-lncRNAs、11个miRNAs和7个mRNAs，为解析lncRNAs通过ceRNA途径调控牛肌内脂肪沉积的分子机制提供了新见解。

　　

Highlight

样本lncRNA表达关系分析

基于lncRNA表达谱的主成分分析（PCA）通过R语言完成（图1）。PCA散点图（图1A）显示组内样本呈分散分布。此外，lncRNA表达相关性热图（图1B）显示所有样本对间的相关系数接近1，表明样本间具有高度相关性。因此，PCA未能有效分离表达谱高度相似的两个样本组。

讨论

肌束间或肌束膜下的特异性IMF沉积受多种调控因子影响，包括转录因子（TFs）和非编码RNA（ncRNAs）。RNA测序技术的进步揭示了lncRNAs在肌内脂肪生成和脂质沉积中的重要作用。此外，IMF沉积同时受分子因素和内部微环境调控。

结论

本研究在牛骨骼肌细胞与肌内脂肪细胞共培养模型中鉴定了差异lncRNA表达谱，构建了260个潜在ceRNA调控网络，为肉牛分子育种和肉品质遗传改良奠定了理论基础。

数据可用性声明

相关数据集和材料可向通讯作者合理获取。本研究所有测序数据已通过NCBI数据库公开，登录号为PRJNA1227253。

作者贡献声明

杨冬梅: 综述撰写、初稿撰写、可视化、验证、实验操作、形式分析、概念化。宋亚平: 综述撰写、可视化、验证、形式分析、数据整理。巩红芳等: 综述撰写。

基金资助

本研究受国家自然科学基金（32202641、32460819）、宁夏自然科学基金（2025AAC040003、2025AAC030558）、中央引导地方科技发展专项（2024FRD05052）及宁夏回族自治区重点研发计划（2024BBF01007、2023BCF01006）资助。

利益冲突声明

作者声明不存在可能影响本研究的已知经济或人际关系冲突。