ICOSLG-ICOS轴介导恶性细胞调控Treg在鼻咽癌微环境中的免疫抑制及其预后意义

《International Immunopharmacology》：Malignant cell-mediated Treg immune suppression via ICOSLG-ICOS axis in tumor microenvironment relates to nasopharyngeal carcinoma prognosis

本研究通过整合单细胞测序（scRNA-seq）和批量转录组数据，利用scissor和scAB分析方法，揭示鼻咽癌（NPC）肿瘤微环境（TME）中恶性细胞（Mal (TUBB2B+)）通过ICOSLG-ICOS轴激活Treg（TNFRSF4+）细胞，进而经由CTLA4-CD80/86等通路抑制免疫细胞功能，阐明了该机制与患者不良预后的关联，为靶向免疫抑制微环境的治疗策略提供新见解。

　　

Section snippets

Patient samples and single-cell transcriptome sequencing

所有实验用患者样本均采集自华西医院耳鼻咽喉科门诊，并通过伦理委员会审查。单细胞RNA测序（scRNA-seq）通过10× Genomics平台完成。采用微流控技术将细胞与携带细胞条形码的磁珠共同封装在液滴中。收集含细胞的液滴后进行细胞裂解，使mRNA结合到磁珠的细胞条形码上。

Identification of cells associated with poor prognosis in NPC via combined analysis of bulk and single-cell RNA sequencing data

为全面探究鼻咽癌（NPC）各细胞类型与患者预后的关系及其在微环境中的作用，我们分析了3个数据集，包含来自36例NPC样本、10例配对NPC外周血样本和4例正常对照样本的269,521个单细胞。质控结果符合标准，多数单细胞检测到200–2500个基因且线粒体基因占比低于10%（图S1A）。所有细胞...

Discussion

本研究探索了NPC细胞类型与患者预后的相关性，以及这些细胞类型在肿瘤微环境中的互作网络。通过scissor和scAB分析，我们发现特定NPC细胞亚型与不良预后显著相关。进一步分析揭示包括Mal (TUBB2B⁺)、Treg (TNFRSF4⁺)、CD8_Tex (OASL⁺)、B (EBI3⁺)、M? (ADAMDEC1⁺)、DC等在内的亚型通过ICOSLG-ICOS轴等通路形成免疫抑制微环境，共同导致NPC预后不良。

Authors' contribution

Yishuai Tan和Jiao Zhou对工作贡献均等，负责概念化与方法学设计；Kai Liu、Zhenru Wu和Ruowu Liu参与数据收集与分析；Jing Zhou和Yan Li负责实验部分；Yu Zhao参与文稿撰写与编辑；Xuelei Ma和Guangbiao Zhou提供关键指导；Jintao Du全面监督研究工作。

CRediT authorship contribution statement

Yishuai Tan： 文稿撰写-审阅与初稿、可视化、验证、监督、软件、资源；Jiao Zhou： 概念化、调研、方法学；Kai Liu： 数据整理；Zhenru Wu： 调研、方法学、验证；Ruowu Liu： 形式化分析；Jing Zhou： 软件、验证；Yan Li： 监督、文稿审阅；Yu Zhao： 形式化分析、资金获取、调研、监督；Xuelei Ma： 监督；Guangbiao Zhou： 监督。