整合TraDIS与蛋白质组学揭示MRSA对β-内酰胺类抗生素的易感组及其调控机制

《International Journal of Antimicrobial Agents》：Exploring the susceptome of methicillin-resistant Staphylococcus aureus to oxacillin and cefazolin using integrated TraDIS and proteomics

本研究采用整合性功能基因组学与蛋白质组学策略，系统解析了耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）在亚抑制浓度β-内酰胺类抗生素（oxacillin/cefazolin）压力下的适应性调控网络。通过TraDIS技术鉴定出50个基因失活可增强细菌适应性（即"易感组"），蛋白质组学进一步揭示严谨反应（stringent response）通路的关键作用，为逆转耐药性提供了新靶点（如relA、mutY等）。

　　

Highlight

通过整合TraDIS和蛋白质组学方法，我们全面解析了MRSA在亚抑制浓度（? MIC）的两种临床相关β-内酰胺抗生素——oxacillin和cefazolin作用下的适应性调控景观。TraDIS技术在基因组范围内鉴定了易感组（susceptome），即一组非必需基因，这些基因的失活能在抗生素暴露期间赋予细菌生长优势。同时，蛋白质组学分析揭示了由严谨反应（stringent response）主导的细菌适应性反应特征，包括氨基酸代谢和寡肽转运通路的上调，以及精氨酸生物合成的下调。

Discussion

为了全面理解调控MRSA对β-内酰胺抗生素适应性和易感性的因素，我们采用整合方法，结合了TraDIS和蛋白质组学，在亚抑制浓度（? MIC）的两种临床相关β-内酰胺抗生素——oxacillin和cefazolin——条件下进行研究。TraDIS使得我们能够在全基因组范围内鉴定出易感组（susceptome），即一组非必需基因，这些基因的破坏能在抗生素暴露期间赋予细菌适应性优势。同时，蛋白质组学分析描绘了在亚抑制浓度抗生素压力下蛋白质组的动态变化，揭示了关键的适应性反应通路。