基于WGCNA的局部晚期宫颈癌放疗敏感性相关T细胞耗竭基因签名构建及其免疫治疗疗效预测研究
《Hormones & Cancer》：Integrated WGCNA retrieval of T-cell exhaustion genes related to radiosensitivity in locally advanced cervical cancer and prediction of immunotherapy efficacy
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时间：2025年10月28日
来源：Hormones & Cancer
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本研究针对局部晚期宫颈癌(LACC)患者放疗敏感性差异大、免疫治疗应答机制不清的临床难题，通过整合多组学数据构建了包含11个关键基因(CCR7、MAP4K1等)的放疗敏感性相关T细胞耗竭(rrTex)基因签名。该签名能有效预测患者预后和免疫治疗疗效，低风险组展现更优生存获益和免疫细胞浸润特征，为LACC个体化免疫-放疗联合策略提供了新型生物标志物。
宫颈癌作为全球女性最常见的恶性肿瘤之一，每年导致数十万患者死亡。尽管同步放化疗(CCRT)已成为局部晚期宫颈癌(LACC)的标准治疗方案超过二十年，但仍有30-40%的患者在治疗后5年内出现复发。近年来，基于免疫检查点抑制剂的治疗方案为LACC患者带来了新希望，然而放疗(RT)诱导的T细胞耗竭(Tex)现象严重限制了免疫治疗的疗效。T细胞耗竭表现为效应功能丧失、抑制性受体上调等特征，直接影响放疗敏感性和免疫治疗效果。因此，深入探索放疗敏感性相关T细胞耗竭机制，建立有效的预后预测模型，对实现LACC精准治疗具有重要意义。
研究团队通过整合多个基因表达数据库(GSE14404、GSE56363等)和TCGA-CESC数据集，采用差异表达分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)和LASSO回归等计算方法，系统筛选与放疗敏感性和T细胞耗竭相关的关键基因。利用PRJEB23709黑色素瘤免疫治疗队列进行跨癌种验证，并通过免疫组化实验在独立LACC队列中验证关键蛋白表达。
研究团队从四个放疗数据集中共鉴定2878个差异表达基因(DEGs)，通过WGCNA分析获得507个放疗敏感性相关T细胞耗竭(rrTex)基因。功能富集分析显示这些基因主要参与T细胞活化、细胞因子-细胞因子受体相互作用等免疫相关通路。
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