基于孟德尔随机化的代谢物-免疫轴因果推断揭示弥漫大B细胞淋巴瘤新型治疗靶点
《Hormones & Cancer》:Deciphering the causal relationships between plasma metabolites, peripheral cells, inflammatory factors and DLBCL for discovering novel therapeutic targets
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时间:2025年10月28日
来源:Hormones & Cancer
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本研究通过整合孟德尔随机化(MR)分析与网络药理学方法,系统评估了1400种血浆代谢物、760种外周细胞及132种炎症因子与弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)的因果关联。研究发现52种代谢物、58种外周细胞及8种炎症因子与DLBCL风险显著相关,鉴定出5个免疫细胞在6种代谢物与DLBCL关联中起中介作用,并通过分子对接和动力学模拟验证了MED1和SULT1A2靶点的成药潜力,为DLBCL的代谢免疫治疗策略提供了新视角。
弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)作为非霍奇金淋巴瘤中最常见的亚型,尽管标准免疫化疗方案R-CHOP可使60%患者获得临床治愈,仍有40%患者面临治疗耐药或复发困境。这种高度异质性疾病的发病机制涉及基因-环境交互作用、慢性免疫失调及血浆代谢重塑等多因素参与,但目前缺乏特异性生物标志物和药物靶点。尤其值得注意的是,代谢重编程在DLBCL发生发展中的作用逐渐被揭示,但代谢物与免疫微环境的交互网络如何影响淋巴瘤进程仍未知。
为系统解析代谢-免疫轴在DLBCL中的作用机制,上海交通大学医学院附属瑞金医院徐明团队联合多家机构,在《Discover Oncology》发表了题为"Deciphering the causal relationships between plasma metabolites, peripheral cells, inflammatory factors and DLBCL for discovering novel therapeutic targets"的研究论文。该研究创新性地整合多组学孟德尔随机化(Mendelian randomization, MR)框架与计算生物学方法,揭示了代谢物通过免疫细胞介导影响DLBCL风险的因果路径,并筛选出具有治疗潜力的靶点化合物。
研究人员采用的核心技术方法包括:基于大规模基因组关联研究(GWAS)汇总数据的双向孟德尔随机化分析(样本来源涵盖CLSA队列8299人、SardiNIA项目3757人、UK Biobank队列408,112人、芬兰队列8293人及FinnGen R11数据库346,491人),中介效应检验(Sobel检验),总结级数据孟德尔随机化(SMR)分析,异质性依赖工具变量(HEIDI)检验,以及分子对接(AutoDock Vina)、分子动力学模拟(Gromacs 2020.6和Amber 20软件)等计算生物学手段。
逆方差加权(IVW)分析显示29种代谢物为DLBCL风险因素(OR>1),23种为保护因素(OR<1)。这些代谢物主要涉及氨基酸(31.1%)、脂质(22.2%)和外源性物质(13.3%)等类别。反向MR分析进一步证实DLBCL遗传易感性与127种代谢物存在反向因果关联。
在760种外周细胞中,58种与DLBCL存在显著因果关联,包括24种免疫细胞显示保护效应(OR<1),33种免疫细胞和1种血细胞(未成熟网织红细胞)增加DLBCL风险(OR>1)。这些细胞涵盖TBNK细胞(18种)、B细胞(15种)、调节性T细胞(Treg)(9种)等亚群。
研究鉴定出8种炎症因子与DLBCL风险相关,其中单核细胞趋化蛋白3(MCP3)和CD5糖蛋白显示保护作用,其余为风险因素。这些发现提示炎症微环境调控在DLBCL发病中具有特异性作用。
通过MetaboAnalyst 6.0和RaMP-DB 2.0平台进行的代谢物集富集分析(MSEA)显示,DLBCL相关代谢物显著富集于药物代谢、氨基酸代谢、谷胱甘肽代谢等122条通路。拓扑分析进一步识别出硫酸盐/亚硫酸盐代谢、硫代谢等关键通路。
通过两步MR分析发现5种免疫细胞在6种代谢物与DLBCL关联中起中介作用。例如未转换记忆B细胞在2,6-二羟基苯甲酸(中介比例16.81%)和异亮氨酸-磷酸盐比值(17.77%)与DLBCL关联中发挥中介作用;CD3+初始CD8+T细胞介导α-羟基异己酸酯效应(15.94%);HLA DR+CD4+T细胞介导X-21,742效应(19.00%)。这些发现揭示了代谢-免疫交叉对话的具体分子路径。
基于SMR鉴定的5个代谢相关基因(MRGs)构建的预后指数(MRGPI)在多变量Cox分析中显示独立预后价值(HR=4.3, 95%CI: 1.7-11.2)。列线图模型在1、3、5年生存率预测中表现出良好校准度,为DLBCL个体化预后评估提供了实用工具。
通过DSigDB数据库筛选出21种靶向代谢基因的候选化合物,其中阿尔法骨化醇(alfacalcidol)和双氢辣椒素(dihydrocapsaicin)分别与MED1和SULT1A2表现出强结合活性(结合能<-7 kcal/mol)。分子动力学模拟显示复合物在100纳秒内保持稳定,结合自由能计算证实相互作用的热力学可行性。
丙氨酸扫描突变显示MED1的Leu-261和SULT1A2的Phe-76为关键结合位点(突变能>0.5)。能量计算表明V262M和V262M|L341M双突变体(结合能-9.5 kcal/mol)以及M256R和M256R|T45W突变体(结合能-8.2 kcal/mol)较野生型具有更强结合亲和力。
该研究通过多组学MR框架首次系统描绘了DLBCL的代谢-免疫调控网络,不仅验证了既往发现的糖石胆酸、脱氢表雄酮硫酸盐(DHEAS)等代谢物与DLBCL的关联,还发现了未转换记忆B细胞等新型免疫中介标志物。特别值得注意的是,中介分析揭示特定免疫细胞亚群可抵消代谢物对DLBCL的有害效应,这为理解免疫编辑在淋巴瘤预防中的作用提供了新视角。
研究创新性地将遗传学发现与药物重定位相结合,鉴定出MED1和SULT1A2作为潜在治疗靶点。MED1作为介导复合物核心亚基,通过维生素D受体(VDR)信号通路发挥抑癌作用;SULT1A2则参与雌激素代谢物灭活过程,其阳性关联提示在DLBCL代谢重编程中的特殊价值。阿尔法骨化醇作为VDR激动剂,其抗增殖和免疫调节特性与MED1靶向治疗的协同作用,为克服R-CHOP耐药提供了新思路。
尽管研究存在人群局限性(仅欧洲裔)和计算预测需实验验证等不足,但通过整合孟德尔随机化、网络药理学和计算生物学等多学科方法,构建了从遗传变异到临床治疗的完整研究链条。这种多尺度分析策略为复杂疾病的机制解析和靶点发现提供了范式,也为DLBCL的精准治疗开辟了代谢免疫干预新途径。
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