N-杂环衍生物作为抗菌剂的计算机模拟(in silico)和体外实验(in vitro)评估:药代动力学/药效学(ADMET)分析、结构-活性关系(SAR)研究及分子对接(molecular docking)

【字体: 时间:2025年10月29日 来源:In Silico Pharmacology

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  研究14种N-杂环衍生物的抗真菌及细菌活性,结合分子对接分析靶点亲和力,揭示结构活性关系,为后续优化提供依据。

  

摘要

N-杂环衍生物框架是抗菌发现的一个有前景的方向,然而将细胞疗效与开发潜力相匹配仍然具有挑战性。我们研究了14种衍生物,以得出定性的结构-活性趋势,并结合了计算机模拟(in-silico)分析方法。这些化合物经过制备后,通过标准化的纸片扩散试验(800 μg/纸片)对Candida albicansC. glabrataEscherichia coliPseudomonas aeruginosaStaphylococcus aureus进行了测试,从而能够在同类化合物中进行比较。观察到了可测量的抑制圈:例如,化合物5(((1 H-1,2,4-triazol-1-yl)methanol)在C. albicans上的抑制圈约为15.2 ± 0.5毫米,在C. glabrata上约为19.8 ± 0.6毫米;而化合物6(((1 H-imidazol-1-yl)methanol)在C. albicans上的抑制圈约为12.8 ± 0.4毫米,在C. glabrata上约为15.3 ± 0.5毫米)。化合物5对E. coli的抑制效果超过26毫米,化合物6对S. aureus的抑制效果达到32毫米,而氨苄西林纸片的抑制圈约为14–15毫米。同时,通过分子对接(AutoDock Vina)在关键靶点AmpC(1KE4)和CYP51(5TL8)上进行的研究显示,几种类似物的结合构象合理,亲和力范围约为?6至?7.8 kcal mol?1,这可以定性理解为提供机制背景信息,而非排名预测。总体而言,这种综合方法提供了机制上的见解和假设生成的构效关系(SAR),有助于基于风险意识的优先级评估,为后续的定量敏感性测试和针对性优化提供指导。

N-杂环衍生物框架是抗菌发现的一个有前景的方向,然而将细胞疗效与开发潜力相匹配仍然具有挑战性。我们研究了14种衍生物,以得出定性的结构-活性趋势,并结合了计算机模拟(in-silico)分析方法。这些化合物经过制备后,通过标准化的纸片扩散试验(800 μg/纸片)对Candida albicansC. glabrataEscherichia coliPseudomonas aeruginosaStaphylococcus aureus进行了测试,从而能够在同类化合物中进行比较。观察到了可测量的抑制圈:例如,化合物5(((1 H-1,2,4-triazol-1-yl)methanol)在C. albicans上的抑制圈约为15.2 ± 0.5毫米,在C. glabrata上约为19.8 ± 0.6毫米;而化合物6(((1 H-imidazol-1-yl)methanol)在C. albicans上的抑制圈约为12.8 ± 0.4毫米,在C. glabrata上约为15.3 ± 0.5毫米。化合物5对E. coli的抑制效果超过26毫米,化合物6对S. aureus的抑制效果达到32毫米,而氨苄西林纸片的抑制圈约为14–15毫米。同时,通过分子对接(AutoDock Vina)在关键靶点AmpC(1KE4)和CYP51(5TL8)上进行的研究显示,几种类似物的结合构象合理,亲和力范围约为?6至?7.8 kcal mol?1,这可以定性理解为提供机制背景信息,而非排名预测。总体而言,这种综合方法提供了机制上的见解和假设生成的构效关系(SAR),有助于基于风险意识的优先级评估,为后续的定量敏感性测试和针对性优化提供指导。

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