利用靶向测序和外显子组测序方法解析印度ALS（肌萎缩侧索硬化症）患者的相关基因变异

《Amyotrophic Lateral Sclerosis and Frontotemporal Degeneration》：Deciphering ALS-linked genetic variants in indian patients using targeted and exome sequencing approaches

本研究分析了238名印度ALS患者的遗传谱，发现13例（6.8%）存在致病或可能致病突变，以SOD1突变最常见，其次为TARDBP、OPTN和NEK1。结果扩展了印度人群ALS的遗传图谱，为精准医学提供基础。

　　

摘要

背景：肌萎缩侧索硬化症（ALS）是一种致命的神经退行性疾病，具有显著的临床和遗传异质性。尽管印度的相关数据仍然有限，但已有研究表明该疾病存在独特的生存模式和区域性的遗传变异。目的：确定印度ALS患者的遗传谱型，并评估已知和新型变异的贡献。方法：我们从印度各地招募了238名临床确诊的ALS患者，所有患者的C9orf72重复序列扩展均呈阴性。遗传检测包括靶向检测、全外显子测序以及对ALS相关基因的筛查。通过等位基因频率阈值、计算机模拟预测和ACMG标准对变异进行优先级排序。结果：在13名患者（6.8%）中发现了致病性或可能致病的变异。SOD1突变最为常见，其次是、OPTN和NEK1。意义不明确的变异更为普遍，其中反复出现的变异提示其可能具有修饰作用。此外，在SETX、ALS2、DISC1、CNTN4和MATR3等基因中还检测到了其他罕见或新型变异。结论：这是印度规模最大的ALS遗传学研究之一。SOD1突变的高发率凸显了人群间的遗传差异，并强调了早期遗传检测的临床重要性，尤其是在基因靶向疗法逐渐普及的背景下。反复出现的变异表明其可能具有修饰作用，这需要进一步的功能验证。这些发现扩展了印度ALS患者的遗传图谱，并为精准医疗方法的应用奠定了基础。