阿根廷野生野猪中猪圆环病毒2型的系统发育分析

《EcoHealth》：Phylogenetic Analysis of Porcine Circovirus Type 2 in Wild Boars from Argentina

猪圆环病毒2型（PCV2）ORF2基因遗传多样性研究。阿根廷2018-2019和2022-2023两季捕获152头野猪，检测发现PCV2阳性率从11.53%升至52.7%。ORF2基因7个完整序列分析显示，5个与中意野猪型'd'（99.14-100%氨基酸相似性）相关，2个与加拿大型'a'（96.54-99.56%）聚类。免疫组化显示抗原仅存于淋巴结。

　　

摘要

PCV2的ORF 2具有高度变异性，可根据其基因型将其分为八种类型，其中类型“b”和“d”在家猪中最为常见。野猪被认为是该病毒的重要宿主，因此我们的目标是研究阿根廷地区PCV2的遗传多样性。根据国家规定，在两个季节共捕获了152只动物。从每只动物身上采集了血液、肺、心脏、肾脏、脾脏、肝脏和淋巴结样本，并通过病毒学和分子生物学方法进行了分析。在2018–2019年期间收集的所有样本中，通过PCR检测出11.53%为PCV2阳性。然而，在2022–2023年期间，这一比例上升至52.7%。通过ELISA检测，2018–2019年的阳性样本总数为71个（占91%），2022–2023年为55个（占74%）。仅通过免疫组化技术在淋巴结样本中检测到了PCV2抗原。从所有PCR阳性样本中，获得了7个完整的ORF2基因序列；其中5个序列与中国和意大利的野猪类型“d”菌株高度相关，氨基酸同源性在99.14–100%之间；另外2个序列与加拿大的一种PCV2类型“a”菌株相关，同源性在96.54–99.56%之间。