象牙凤螺热休克蛋白超家族全基因组鉴定及其热应激响应机制研究
《Comparative Biochemistry and Physiology Part D: Genomics and Proteomics》:Genome-wide identification and characterization of the HSP gene superfamily in the Ivory Shell (
Babylonia areolata)
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时间:2025年10月29日
来源:Comparative Biochemistry and Physiology Part D: Genomics and Proteomics 2.2
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本研究通过生物信息学方法在象牙凤螺(Babylonia areolata)基因组中鉴定出68个热休克蛋白(HSP)基因,系统解析其家族分类、染色体分布及基因结构特征,并结合qPCR实验揭示该基因家族在热应激下的组织特异性表达模式与"先升后降"的动态调控规律,为软体动物环境适应性分子机制研究提供重要理论依据。
Identification of HSP gene family in B. areolata
基于NCBI数据库下载的象牙凤螺全基因组数据(登录号JBFRHL000000000),通过隐马尔可夫模型(HMM)筛选和保守结构域验证,最终鉴定出68个BaHsp基因,涵盖Hsp10、Hsp20、Hsp40(分Ⅰ/Ⅱ/Ⅲ型)、Hsp60、Hsp70和Hsp90六个亚家族。
Identification and chromosomal distribution of the HSP genes in B. areolata
基因定位分析显示68个BaHsp基因不均匀分布于25条染色体上(附图1),其中BaHsp40家族成员数量最多(34个),而BaHsp10仅含1个成员。串联复制事件在BaHsp20、BaHsp40和BaHsp90家族中显著富集,暗示这些基因家族通过复制扩张实现功能分化。
作为关键分子伴侣,BaHsp基因通过调控蛋白质折叠稳态参与热应激响应。与双壳贝类相比,象牙凤螺Hsp40家族成员数量显著增多,可能与其作为腹足类动物的特殊环境适应性相关。鳃组织中BaHsp基因的高表达及热应激下的快速上调模式,印证了该组织在温度感知中的前沿作用。
本研究首次系统揭示象牙凤螺HSP基因超家族的基因组特征与表达规律,为深入解析软体动物热耐受分子机制及抗逆品种选育提供靶点资源。
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