越南中南部高原单穗省藤种群遗传多样性与变异的比较基因组学研究

《Ecological Genetics and Genomics》：Study on population genetic diversity and variation of Calamus poilanei Conrard in the Southern Central Highlands, Vietnam

本文采用SCoT、ISSR和CBDP三种DNA指纹技术，首次系统评估越南中南部高原两个单穗省藤（Calamus poilanei）自然种群的遗传多样性。研究发现两地种群遗传多样性中等（He=0.25-0.26），基因流强劲（Nm=12.88），遗传分化微弱（GST=0.037）。研究为濒危藤种保育提供了分子依据，并验证了SCoT标记在省藤属研究中的优势。

　　

章节亮点

遗传多样性

基于三种技术整合数据表明，调查区域内两个种群及物种整体遗传多样性处于中等水平。达克RLap种群遗传多样性参数（预期杂合度H_e=0.2529，香农指数I=0.3826，多态位点比例PPB=82.3%）略高于吉仙种群（H_e=0.2498, I=0.3772, PPB=78.47%）。物种层面遗传多样性更高（H_e=0.2611, I=0.3998, PPB=92.34%）。个体间遗传相似系数在吉仙种群为0.536-0.933，达克RLap种群为0.565-0.914，整体物种为0.512-0.933。

讨论

尽管单穗省藤在越南及邻国多个地区均有分布，本研究仅针对中南部高原两个种群开展调查，样本量的限制是本研究的显著不足。

结论

本研究通过三种DNA指纹技术揭示了两个单穗省藤种群的遗传背景。尽管存在地理隔离，两种群仍表现出较高的遗传多样性和较低的遗传分化，这可能由传粉媒介和种子传播动物驱动的强劲基因流所致。达克RLap种群遗传多样性略高于吉仙种群，而个体间遗传相似系数差异显著。三种标记在评估基因流（N_m）、遗传分化（G_ST）和遗传距离（D）时结果一致，其中SCoT标记综合表现最优。研究成果可为该濒危藤种的保育和可持续利用提供科学依据。

CRediT作者贡献声明

Le Hong En：资源获取，调查。Trieu Ngoc Le：文稿撰写与修订，原始草案撰写，方法论，调查，形式分析，概念化。Nguyen Van Ket：原始草案撰写，验证，监督，调查。Pham Trong Nhan：资源获取，项目管理，概念化。

利益冲突声明

作者声明不存在利益冲突。

出版同意书

所有作者同意在本期刊发表。

数据与材料可用性

本研究所有数据均包含在本文中。

伦理批准与参与同意

不适用。

数据可用性

本研究使用的DNA指纹数据可在Mendeley Data网站获取：https://doi.org/10.17632/dsrwktd67h.1

竞争利益声明

作者声明不存在竞争利益。

致谢

感谢越南科学技术部对本研究的资金支持（项目编号：NVQG-2020/DT.13）