使用简化的一次性拭子采样方法与不同采样方法获得的舌苔微生物群谱的比较：一项初步研究

《Clinical Oral Investigations》：Comparable tongue coating microbiota profiles from a simplified single-swab versus different sampling approaches: A pilot study

本研究评估了舌苔微生物组采样方法的可靠性，比较单次/多次刮擦及不同工具的采样效果，通过宏基因组测序发现单次刮擦与多次刮擦在α/β多样性、属种水平菌群组成及KEGG功能预测上无显著差异，证实单次无菌纤维拭子刮擦法可行且经济，为标准化采样提供依据。

　　

摘要

目的

舌苔微生物群已被视为系统性疾病的一个潜在生物标志物。然而，由于缺乏实用且广泛适用的采样方案，这限制了不同研究之间的可比性，并阻碍了其临床应用。本初步研究旨在评估不同采样方法的可靠性。

材料与方法

使用四种不同的方法从健康成年人中采集舌苔样本，包括用无菌拭子或刮刀进行单次或多次刮取。通过宏基因组测序来评估微生物多样性、分类组成和预测的功能特征。分析了DNA提取质量、α-多样性和β-多样性指标、属和种水平的分类丰度以及基于KEGG的功能预测。同时考虑了舌苔生物膜的空间和结构特征，以解释微生物采样的一致性。

结果

单次刮取方法得到的微生物谱与多次刮取方法相当，在α-多样性和β-多样性方面没有显著差异。各组之间的属和种水平的分类组成一致，主要菌群包括链球菌、普雷沃氏菌和罗氏菌。通过KEGG注释进行的功能预测显示各组之间的差异很小，只有少数代谢途径存在统计学上的显著差异。这些发现突显了舌苔微生物群的空间稳定性和代表性采样潜力。

结论

使用无菌簇状拭子进行单次刮取是一种实用、可重复且成本效益高的舌苔微生物群采样方法。这些初步结果表明，这种简化方法能够获得健康成年人的代表性微生物组数据，但在临床应用之前，仍需在更大规模和更多样化的队列中进行验证。

临床意义

本研究表明，单次刮取采样方法得到的舌苔微生物群谱与传统的多次刮取方案相当。这些发现支持其在未来大规模研究中标准化采样的潜力。

试验注册

ITMCTR2024000616。