综述:人类SGLTs的分子机制与计算见解:迈向选择性SGLT1抑制的进展
《Frontiers in Molecular Biosciences》:Molecular mechanisms and computational insights into human SGLTs: advancing toward selective SGLT1 inhibition
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时间:2025年10月30日
来源:Frontiers in Molecular Biosciences 4.0
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本综述系统梳理了钠-葡萄糖协同转运蛋白(SGLTs)的结构生物学与计算模拟研究进展,重点聚焦于利用冷冻电镜(cryo-EM)、分子动力学(MD)模拟及人工智能(如AlphaFold2)等技术揭示SGLT1与SGLT2的构象动力学、抑制剂结合模式及选择性差异,为理性设计高选择性SGLT1抑制剂(其在糖尿病、心血管疾病及癌症管理中潜力巨大)提供了新的综合框架与策略。
引言:SGLTs概述
钠-葡萄糖协同转运蛋白(SGLTs)是一类重要的膜蛋白,在葡萄糖稳态中扮演关键角色。它们利用钠离子(Na+)的电化学梯度作为驱动力,以次级主动转运的方式将葡萄糖逆浓度梯度摄入细胞。SGLT家族中,SGLT1和SGLT2是研究最为深入的治疗靶点。尽管SGLT2抑制剂已在临床上广泛应用,但选择性SGLT1抑制剂的开发仍是一个尚未实现的目标,尽管其在管理糖尿病、心血管疾病和癌症方面展现出巨大潜力。
SGLT家族成员
SGLT家族属于SLC5A溶质载体家族,包括至少6种葡萄糖/己糖协同转运蛋白亚型(SGLT1-6)。SGLT1主要在小肠和肾脏近端小管S3段表达,负责肠道葡萄糖和半乳糖的吸收以及肾脏滤液中约10%的葡萄糖重吸收。它是一个高亲和力、低容量的转运蛋白,具有2:1的Na+-葡萄糖化学计量比。SGLT2则主要分布在肾脏近端小管S1和S2段,负责约80-90%的滤过葡萄糖重吸收,是一个低亲和力、高容量的转运蛋白,化学计量比约为1:1。SGLT3功能独特,它不转运葡萄糖,而是作为葡萄糖传感器。SGLT4、SGLT5和SGLT6则分别对甘露糖、果糖和肌醇等底物具有偏好性。
SGLT的结构特征
SGLTs是含有14个跨膜螺旋(TM0-TM13)的整合膜蛋白,具有典型的LeuT折叠结构。这种结构支撑着其“交替存取”的转运机制,即在向外开放、闭塞和向内开放等构象状态之间循环,从而耦合Na+和葡萄糖的转运。近年来,冷冻电镜技术的突破使得解析人类SGLT1和SGLT2的高分辨率结构成为可能,极大地增进了我们对底物/抑制剂结合和构象动力学的理解。
结构比较揭示,SGLT1和SGLT2在整体结构上保守,但也存在关键差异。例如,SGLT1拥有一个额外的钠离子结合位点Na3,而该位点在SGLT2中缺失。此外,SGLT2的胞外环EL5c上有一个组氨酸(H268),它与F98等残基形成一个“芳香笼”,增强了抑制剂(如达格列净)的结合,而SGLT1在相应位置是天冬氨酸(D268),不具备此特征。这些结构差异是设计选择性抑制剂的重要基础。
分子动力学(MD)模拟为静态结构注入了动态视角,揭示了转运蛋白的灵活性、底物结合机制和能量景观。模拟结果显示,Na+的结合稳定了向外开放的构象,而它的释放则促进了向内向开放状态的转变。
SGLT的转运周期与抑制机制
SGLT的转运周期始于向外开放状态(C1-C2),细胞外的Na+首先结合(在SGLT1中结合于Na2和Na3位点,SGLT2中仅为Na2位点),稳定该构象并为葡萄糖结合做准备。随后葡萄糖结合,转运体进入闭塞状态(C3)。接着发生显著的构象变化,转变为向内开放状态(C4-C6),将Na+和葡萄糖释放到胞质内。Na+的释放是随机的,并不严格遵循先糖后钠的顺序。最后,转运体复位到向外开放状态,完成一个循环。整个过程约在20毫秒内完成。
SGLT抑制剂(如天然产物根皮苷和合成药物格列净类)通常结合在向外开放的构象。它们的糖基部分占据葡萄糖结合腔,与保守残基(如N75/N78, H80/H83, Q457等)形成氢键;而糖苷配基部分则伸入由跨膜螺旋形成的胞外前庭,通过疏水相互作用等稳定结合。这种结合有效地“锁住”了转运蛋白,阻止其向内向开放状态转变,从而抑制葡萄糖的转运。研究表明,抑制剂的结合还会影响SGLT1固有的水通道功能,可能减少跨膜水渗透。
计算生物学在SGLT研究中的角色
计算方法是理解SGLT分子机制不可或缺的工具。同源建模可以基于已知结构预测未知SGLT亚型(如SGLT3-6)的三维结构。人工智能系统AlphaFold2能够高精度地预测蛋白质结构,其预测的SGLT1和SGLT2模型与实验解析的冷冻电镜结构高度一致,验证了其在膜蛋白研究中的价值。分子动力学(MD)模拟可以可视化构象变化,探究钠离子结合的稳定性以及抑制剂与蛋白的动态相互作用。结合自由能计算(如MM/GBSA方法)可以定量评估抑制剂与靶标的结合强度,并识别关键结合残基,这些计算结果与点突变实验数据高度吻合。三维参考相互作用位点模型(3D-RISM)水合分析则能预测结合位点周围的水合作用,解释水分子介导的相互作用如何稳定抑制剂结合。
这些计算预测与冷冻电镜结构解析、点突变、葡萄糖摄取/结合测定等实验方法相互验证,形成了一个强大的“收敛性”研究流程,将结构与功能紧密联系起来。
临床意义与选择性SGLT1抑制的未满足需求
SGLT2抑制剂已成为治疗2型糖尿病、心衰和慢性肾病的重要药物,其获益部分独立于降糖作用。然而,选择性抑制SGLT1具有独特的治疗潜力。通过抑制肠道SGLT1,可以减少葡萄糖吸收,刺激胰高血糖素样肽-1(GLP-1)分泌,从而改善血糖控制,并可能对心脏产生益处。双效SGLT1/SGLT2抑制剂索格列净已获批用于心衰治疗。此外,SGLT1在多种癌细胞(如三阴性乳腺癌、结直肠癌)中高表达,与肿瘤生长和不良预后相关,使其成为有潜力的抗癌靶点。
尽管前景广阔,实现高选择性SGLT1抑制仍面临挑战,主要障碍在于SGLT1和SGLT2结构的高度相似性。当前策略集中于利用已发现的细微差异:靶向SGLT1特有的Na3位点;设计分子与SGLT1的EL5c环上的极性残基(如D268)形成特异性相互作用;充分利用SGLT1中央结合腔更大的空间;以及探索靶向转运蛋白二聚化界面或调控蛋白MAP17相互作用位点等变构调节策略。
结论与展望
选择性SGLT1抑制剂的开发是糖尿病、心血管疾病和癌症治疗领域一个充满希望但尚未实现的目标。整合冷冻电镜、AlphaFold2预测、分子动力学模拟、自由能计算和人工智能等先进计算与实验方法,为我们提供了前所未有的原子水平视角来理解SGLT的分子机制。通过聚焦于SGLT1与SGLT2之间的关键结构差异(如Na3位点、EL5c环、中央结合腔尺寸等),并采用变构调节等创新策略,有望克服选择性难题。未来,持续将计算预测与实验验证相结合,将加速推动针对SGLT1的理性药物设计,最终实现其巨大的治疗潜力。
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