基于分子评估与气候风险分析的来檬(Citrus aurantiifolia)遗传多样性及保护策略研究

《Biocatalysis and Agricultural Biotechnology》：Conservation Strategies for Citrus aurantiifolia (Christm.) Swingle: Insights From Molecular Assessment of Genetic Diversity, Population Structure, and Climatic Risk Analysis

本文综合运用CBDP、iPBS和SCoT三种分子标记及MaxEnt生态位模型，系统评估了印度东北部来檬(Citrus aurantiifolia)的遗传多样性、种群结构及气候适应性。研究发现高种群分化(GST=0.566)、低基因流(Nm=0.383)及栖息地收缩趋势，为这一重要经济作物的保护与可持续利用提供了分子生态学依据。

　　

标记有效性

通过CBDP、iPBS和SCoT三种标记系统共获得420条多态性条带，条带大小范围250-3000 bp。其中10个CBDP引物产生85条多态性条带，平均每个引物产生8.5条；iPBS和SCoT引物分别产生141条和194条多态性条带。所有标记的平均PIC（多态性信息含量）为0.283，表明标记具有较高信息量。Mantel检验证实三种标记的遗传距离矩阵间存在显著相关性。

标记信息量分析

分子标记评估多样性效果的关键在于其多态性检测能力。本研究所用标记系统的PIC值范围0.173-0.384，显示其具有中等偏高的等位基因鉴别能力。值得注意的是，虽然显性标记的PIC值通常低于共显性标记，但本研究通过组合多种标记类型有效提升了整体分辨率。

保护启示

对来檬遗传多样性、种群结构和生态位建模的综合研究，为制定科学保护策略提供了重要依据。AMOVA揭示的种群内低多样性、高种群分化(G_ST=0.567)、多重遗传屏障及有限基因流(Nm<1)等现状，提示需要采取紧急保护措施。建议通过建立种质资源库、设计人工基因走廊等策略增强种群间遗传交流。

结论

本研究首次整合多种分子标记（CBDP、iPBS、SCoT）与生态位模型，系统评估了印度东北部来檬的遗传格局与气候适应性。结果揭示了种群内遗传变异不足、种群间高度分化及显著近交现象，凸显了该物种面临的遗传隔离挑战。贝叶斯种群结构分析为优先保护单元划定提供了直接依据，而气候模型预测的适宜生境收缩趋势则强调了采取适应性保护措施的紧迫性。