光控抗体纯化新策略:Fc特异性单价蛋白G工程化消除抗体交联
《Scientific Reports》:Engineering of an Fc-specific monovalent protein G for the light-controlled affinity purification of antibodies
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时间:2025年11月01日
来源:Scientific Reports 3.9
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本文报道了一种创新的蛋白G工程化策略,通过定点突变(Asn478→Arg)消除其Fab结合活性,获得仅保留Fc高亲和力的单价变体Azo-ProtGN478R。该变体解决了传统多价蛋白G在溶液中引发抗体交联沉淀的难题,成功应用于光控亲和层析技术(Excitography),实现从高血清培养基中一步分离单克隆抗体(mAb),避免了酸性洗脱对抗体结构的损伤,为抗体药物纯化提供了温和高效的新工具。
在生物医学研究和抗体药物制造中,单克隆抗体(mAb)的高效纯化是保证其功能与安全性的关键环节。目前,基于细菌免疫球蛋白结合蛋白(如蛋白A、蛋白G)的亲和层析技术虽广泛应用,却存在明显局限:酸性洗脱条件易导致抗体聚集和天冬酰胺(Asn)、谷氨酰胺(Gln)侧链脱酰胺化,损害抗体完整性。更棘手的是,天然蛋白G的单个Ig结合域(如C2结构域)具有双价结合特性——既能高亲和力结合IgG的Fc区域,又能以较低亲和力结合Fab区域。当蛋白G作为溶液中的适配体分子用于光控亲和纯化时,这种双价活性会引发抗体分子交联,形成不溶性免疫复合物,严重干扰纯化效率。
为解决这一难题,Peter Mayrhofer与Arne Skerra团队在《Scientific Reports》上发表研究,通过对蛋白G进行精准工程化,成功开发出一种仅特异性结合Fc的单价变体Azo-ProtGN478R,彻底消除了抗体交联现象,并验证了其在光控纯化中的高效性与通用性。
研究中主要采用以下关键技术:基于晶体结构分析选定Asn478为关键突变位点;通过定点突变(N478R)与琥珀密码子抑制技术合成Azo标签化蛋白G变体;借助浊度测定、动态光散射(DLS)和表面等离子共振(SPR)评估突变体与抗体/Fab/Fc的互作特性;利用Excitography技术实现在生理缓冲条件下通过紫外A光(355 nm)触发洗脱的抗体纯化流程。
研究发现,野生型Azo-ProtG与不同治疗性抗体(如曲妥珠单抗、贝伐珠单抗、利妥昔单抗)混合时,在特定化学计量比下(尤其是1:4,mAb:ProtG)会形成大量沉淀,其浊度-浓度曲线符合经典的Heidelberger-Kendall沉淀反应规律:在抗体过量区沉淀较少,等价区沉淀最大,蛋白G过量区沉淀重新减少。该现象源于蛋白G可同时结合一个抗体的Fc和另一个抗体的Fab,形成交联网络。
Asn478→Arg突变有效消除Fab结合活性而不影响Fc亲和力
通过结构分析发现,蛋白G的Asn478位于其与Fab结合的界面,与Fab重链的Pro126、Val128形成氢键。将其突变为精氨酸(Arg)后,Azo-ProtGN478R完全丧失Fab结合能力(SPR检测中Fab结合响应消失),而对Fc的亲和力仅略有下降(KD从~500 nM变为~680 nM)。该突变体热稳定性甚至略有提升(Tm=79.8°C vs 78.7°C),且表达量与原版相当。
Azo-ProtGN478R在光控纯化中展现优异性能
在模拟细胞培养上清(含10%胎牛血清的DMEM培养基)中,加入Azo-ProtGN478R后未出现沉淀,而野生型蛋白G则引发显著浊度上升。通过Excitography技术,突变体成功从高背景蛋白中一步纯化出三种治疗性抗体,洗脱产物经SDS-PAGE验证纯度极高,且洗脱过程仅需紫外A光照射,无需低pH缓冲液,最大限度保持抗体天然构象。
本研究首次通过单点突变(Asn478→Arg)实现了蛋白G从双价向单价结合特性的转化,解决了其在实际应用中引发抗体交联的核心问题。Azo-ProtGN478R不仅保留了与Fc的高亲和力,而且完全消除了对Fab的结合活性,使其成为光控抗体纯化技术的理想适配体。该变体的成功开发拓展了Excitography技术在抗体研究中的应用前景,尤其为需要温和纯化条件的功能性抗体制备(如体内研究、细胞实验)提供了新方案。此外,该工程化策略也为其他多价结合蛋白的理性改造提供了重要参考,有望推动抗体纯化技术向更高效、更温和的方向发展。
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