碳青霉烯类耐药肠杆菌群定植患者与自然清除患者的粪便微生物群组成及临床特征比较

《Infection》：Fecal microbiota composition and clinical characteristics of patients with carbapenem-resistant enterobacterales colonization vs. patients with spontaneous decolonization

肠道菌群差异与CRE持续定植及死亡率的关系。比较37例CRE定植患者中持续定植组（Col，14例）与自愈组（DeCol，23例）的肠道菌群，发现beta多样性差异（p=0.013），DeCol组富集Suterella、Roseburia faecis、Eubacterium ventriosum，Col组Ruthenibacterium lactatiformans更丰富。Col组1年死亡率显著高于DeCol组（43% vs 9%, p=0.035）。

　　

摘要

引言

碳青霉烯类耐药肠杆菌（CRE）在肠道中的定植是后续感染的关键风险因素。肠道微生物群的组成可能在这一过程中起着重要作用。本研究的目的是比较定植（Col）患者与去定植（DeCol）患者之间的肠道微生物群组成差异。

方法

研究对象来自一个CRE定植患者的数据库。这些患者被分为当前处于定植状态（Col）或已自发去定植状态（DeCol）两类。同时收集了基线特征数据以及肠道微生物群特征分析后次年的生存情况，并对肠道微生物群进行了分析。

结果

共有37名患者纳入研究：其中14人属于Col组，23人属于DeCol组。在年龄、BMI、性别、KATZ指数、毒物暴露、饮食和合并症方面未观察到显著差异。Col组患者之前住院的频率更高，且更常发生由CRE和/或其他微生物引起的感染。在12个月的随访期间，Col组的死亡率更高（Col组43%，DeCol组9%，p=0.035）。根据定植状态的不同，肠道微生物群的β多样性存在差异（Bray Curtis距离检验，PERMANOVA分析，p=0.013），但近期抗生素使用或住院情况并未影响这一差异。DeCol组患者中Suterella、Roseburia faecis和Eubacterium ventriosum的数量有所增加。CRE定植与Ruthenibacterium lactatiformans的数量增加有关。

结论

持续存在CRE定植的患者与成功去定植的患者之间的粪便微生物群组成存在差异。需要进一步研究以评估某些特定细菌类群是否可作为长期定植风险的标志物。