选择性PDE4B/PDE4D双功能降解剂的发现及其在慢性炎症性疾病治疗中的潜力
《Journal of Translational Autoimmunity》:Discovery of a PDE4B and PDE4D selective bifunctional degrader for management of chronic inflammatory disorders
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时间:2025年11月02日
来源:Journal of Translational Autoimmunity 3.6
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本研究针对传统PDE4抑制剂在特应性皮炎等慢性炎症性疾病治疗中存在的选择性差、中枢神经系统副作用等问题,开发了新型PDE4B/PDE4D选择性双功能降解剂。研究证实降解剂BTX-AP04能通过CRBN介导的泛素-蛋白酶体途径特异性降解PDE4B/D,在体外实验中其抑制炎性细胞因子释放的效力比传统抑制剂高1000倍,并在小鼠模型中展现出良好的药代动力学特征和治疗效果,为炎症性皮肤疾病提供了更安全有效的治疗新策略。
在慢性炎症性疾病治疗领域,磷酸二酯酶4(PDE4)一直是一个备受关注的治疗靶点。作为特异性水解环磷酸腺苷(cAMP)的关键酶,PDE4在免疫细胞中高度表达,通过调控cAMP水平影响炎症反应进程。目前临床使用的PDE4抑制剂,如阿普斯特(Apremilast)和罗氟司特(Roflumilast),虽然能够有效缓解炎症症状,但普遍存在中枢神经系统副作用(如恶心、呕吐等)和选择性不足的问题,这严重限制了其长期临床应用。
特应性皮炎(AD)作为一种常见的慢性炎症性皮肤疾病,全球有超过1500万患者受其困扰。该疾病的发病机制涉及辅助性T细胞2(TH2)和17(TH17)等多种免疫细胞的异常活化,导致促炎细胞因子大量释放,皮肤屏障功能受损。尽管现有治疗方法包括局部抗炎药物、生物制剂等,但大多存在疗效有限或安全性问题。因此,开发具有更高选择性和安全性的PDE4靶向治疗策略成为当务之急。
近年来,靶向蛋白降解技术(TPD)的兴起为药物研发带来了新的思路。特别是蛋白降解靶向嵌合体(PROTAC)等双功能降解剂,能够利用细胞内天然的泛素-蛋白酶体系统特异性降解靶蛋白,不仅克服了传统抑制剂"占据驱动"模式的局限性,还展现出催化性、长效性等独特优势。基于这一背景,Biotheryx公司的研究团队开展了一项创新性研究,致力于开发选择性PDE4B和PDE4D亚型的双功能降解剂,相关成果发表在《Journal of Translational Autoimmunity》上。
研究团队采用了一系列关键技术方法开展此项工作。他们通过分子对接和分子力学优化,设计了以Apremilast为靶标结合配体、以CRBN E3连接酶配体为降解元的新型双功能降解剂。利用蛋白质免疫印迹(Western blot)技术系统评估了降解剂对PDE4各亚型的降解效率,并通过HiBiT荧光素酶报告基因实验分析了降解剂对CRBN已知新底物的选择性。研究还采用电化学发光免疫分析(MSD)和FRET(荧光共振能量转移)技术检测细胞内cAMP水平变化,并在oxazolone诱导的小鼠特应性皮炎模型和人工外周血单核细胞(PBMC)诱导的移植物抗宿主病(GvHD)模型中评估了降解剂的体内药效学特征。
3.1. 在人源细胞中实现PDE4的强效选择性降解
研究人员首先在人工外周血单核细胞(PBMC)中验证了先导降解剂BTX-AP04对PDE4四个亚家族(A-D)的降解效果。结果显示,BTX-AP04能够快速、剂量依赖性地降解PDE4B和PDE4D,最大降解率可达86%,而对PDE4A和PDE4C的降解效率低于40%。特别值得注意的是,降解剂在4小时即可观察到明显的降解效果,展现了快速起效的特点。
为了建立更优化的体外评价模型,团队筛选了9种人源癌细胞系,发现A549细胞中PDE4D(长短异构体)的表达水平显著高于其他细胞系。进一步实验证实,BTX-AP04在A549细胞中能够有效降解PDE4B和PDE4D,对短异构体的最大降解率可达95%。通过分子模拟分析,研究人员发现降解剂与CRBN和PDE4D之间形成多重相互作用,包括连接区-NH与CRBN的Ser227和Asp272之间的氢键,这为降解剂的高效性提供了结构基础。
3.2. PDE4降解剂实现更显著的cAMP积累且降解活性依赖CRBN
cAMP作为重要的第二信使,其水平升高是PDE4抑制剂发挥抗炎作用的关键机制。研究团队比较了传统PDE4抑制剂与降解剂BTX-AP03对PBMC中cAMP积累的影响。结果显示,BTX-AP03能够诱导剂量依赖性的cAMP积累,其效力比传统抑制剂强2倍以上。通过FRET技术使用EPAC-SH187 cAMP传感器进一步验证了这一结果。
为了确认降解活性的CRBN依赖性,研究人员合成了N-甲基化版本的BTX-AP04(BTX-AP04me)。实验证实甲基化显著降低了降解剂在药理相关浓度下的PDE4D降解能力,但在高浓度时仍显示一定的脱靶活性。更重要的是,降解剂展现出与传统抑制剂不同的催化特性:在A549细胞中,BTX-AP08处理24小时后,即使洗脱化合物,PDE4D蛋白水平在48小时内仍保持低位,表明蛋白再合成速率较慢,降解剂具有长效作用优势。
3.3. PDE4降解剂在抑制炎性细胞因子方面优于PDE4抑制剂
在抗CD3ε和抗CD28抗体刺激的PBMC模型中,研究人员系统评估了多种化合物对炎性细胞因子释放的抑制能力。数据显示,先导降解剂BTX-AP04和BTX-AP05对肿瘤坏死因子α(TNFα)的半数抑制浓度(IC50)比临床使用的Apremilast低1000倍,对其他细胞因子(如IFNγ、IL-2、IL-1β等)也表现出相似的高效力。
通过CRBN竞争实验,研究人员进一步证实了降解活性的特异性。当加入100倍摩尔浓度的CRBN竞争剂时,降解剂的效力下降约200倍,其IC50值与Apremilast相当。同时,BTX-AP04me完全丧失了抑制炎性细胞因子表达的能力。安全性评估显示,先导降解剂对CRBN已知新底物(如Sall4、Aiolos、Ikaros等)的稳定性没有影响,表明其具有较高的特异性。
3.4. PDE4降解剂在特应性皮炎小鼠模型中展现良好的暴露量和疗效
药代动力学研究显示,不同结构的降解剂具有不同的物种特异性。BTX-AP02能够降解小鼠和人的PDE4D,但口服生物利用度较低(0.44%);而BTX-AP04仅降解人源PDE4D,口服生物利用度达14.6%,暴露量(AUC)为7030 hr*ng/mL。
在oxazolone诱导的小鼠特应性皮炎模型中,腹腔注射BTX-AP02能够剂量依赖性地降解脾脏和关节组织中的PDE4D,且对CRBN新底物(Aiolos、Ikaros、CK1α)没有影响。疗效实验表明,BTX-AP02在减轻耳部肿胀方面与已批准疗法(地塞米松、Apremilast、Ruxolitinib等)效果相当。更重要的是,降解剂在耳组织中显著降低了IL-2、IL-4、IL-6等炎性细胞因子的水平,且效果优于Ruxolitinib。
3.5. 口服生物可利用的PDE4降解剂在GvHD模型中表现更优疗效
研究团队还开发了口服生物利用度更高的降解剂(BTX-AP04、BTX-AP06、BTX-AP07),其口服生物利用度在14.6%-29%之间。在人工PBMC诱导的NCG小鼠GvHD模型中,口服BTX-AP04治疗显著提高了小鼠生存率,效果优于PDE4抑制剂和环孢素A,与JAK1/2抑制剂Ruxolitinib相当。
血浆细胞因子分析显示,BTX-AP04治疗组小鼠的TNFα水平显著低于其他治疗组。从第16天到第42天,所有治疗组的GvHD评分均显著低于对照组。这些结果表明,PDE4降解不仅能够有效下调TNFα表达,还能延迟GvHD症状的出现。
研究结论与讨论部分强调了PDE4降解剂相对于传统抑制剂的独特优势。通过CRBN介导的泛素-蛋白酶体途径特异性降解PDE4B/D,降解剂能够更有效地积累cAMP,进而抑制蛋白激酶A(PKA)-cAMP反应元件结合蛋白(CREB)通路活化,最终减少核因子κB(NFκB)等转录因子的活性,降低TH1、TH2、TH17等免疫细胞的炎性细胞因子释放。
与传统"占据驱动"的抑制剂不同,降解剂的催化作用机制使其能够以更低剂量、更少频次给药,同时由于血脑屏障透过性低,可能减少中枢神经系统相关副作用。此外,降解剂对PDE4B和PDE4D亚型的选择性降解,避免了同时抑制所有PDE4亚型可能带来的脱靶效应。
该研究不仅为特应性皮炎的治疗提供了新策略,也为其他PDE4相关疾病(如银屑病、慢性阻塞性肺疾病等)的药物研发开辟了新方向。随着蛋白降解技术的不断发展,PDE4降解剂有望成为下一代抗炎治疗的重要工具,为慢性炎症性疾病患者带来更安全、有效的治疗选择。
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