从应激到稳态：基于质谱的未折叠蛋白应答（UPR）与蛋白质稳态调控新视野

《Advances in Biological Regulation》：From Stress to Homeostasis: Mass Spectrometry–Based Insights into the Unfolded Protein Response (UPR) and Proteostasis

本综述系统阐述了未折叠蛋白应答（UPR）作为内质网应激核心调控网络的作用，重点介绍了基于液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）的蛋白质组学技术在解析ATF6、IRE1、PERK等UPR信号分支蛋白水平动态调控方面的独特优势。文章指出该技术为揭示UPR在癌症、衰老等疾病中的机制提供了新视角，对靶向药物开发具有重要指导意义。

　　

章节精选

蛋白质稳态（Proteostasis）网络的作用

一个健康的蛋白质组其特征在于蛋白质的正确合成、折叠成其精确的三维结构、维持适当的丰度、准确运输至其细胞目的地以及在不再需要时被及时降解。为了支持这种动态平衡，大约有2,500个基因协同调控蛋白质稳态（proteostasis）的各个方面^{1, 2}。这些基因包括那些参与生产细胞组分以支持蛋白质...

生化检测方法

用于测量生物样本中UPR激活的常用方法包括转录组学、定量聚合酶链反应（qPCR）、蛋白质印迹（Western blotting）、荧光素酶报告基因检测、酶联免疫吸附试验（ELISA）和免疫荧光显微镜技术。每种技术都在转录、翻译和翻译后水平为UPR激活提供了独特的见解，从而对通路参与度和细胞应激状态提供了互补性的认知。

先前的工作...

结论性评述与未来展望

虽然转录组学和蛋白质印迹法常被用于检测UPR的激活，但基于LC-MS/MS的蛋白质组学为在蛋白质水平上大规模、定量表征不同生物学背景下的该通路提供了一个尚未被充分利用的途径。为了解决这一空白，我们开发了一个分析流程（在多个出版物中均有描述），该流程专门为UPR信号传导的蛋白质组学研究量身定制，并结合了用于自下而上LC-MS/MS分析的分支特异性靶标。