快速基因组测序与基因检测面板在疑似遗传疾病的危重婴儿中的比较：一项经济评估

《The Journal of Pediatrics》：Rapid Genome Sequencing Compared with a Gene Panel in Critically Ill Infants with a Suspected Genetic Disorder: An Economic Evaluation

早期全基因组测序（rGS）可显著降低重症婴儿首年医疗成本，相比靶向测序（NewbornDx）加后期rGS策略节省约15.8万美元/患者。研究通过多中心前瞻性数据构建决策树模型，证实rGS upfront虽成本更高（1.2万美元 vs 2,449美元），但避免后续必要测序，总成本更低。结论强调早期rGS的经济学优势及医保覆盖需求。

　　

Tara A. Lavelle|Jill L. Maron|Stephen F. Kingsmore|Ching-Hsuan Lin|Yingying Zhu|Benjamin Sweigart|Dallas Reed|Bruce D. Gelb|Jerry Vockley|Jonathan M. Davis

健康风险评估中心，塔夫茨医学中心临床研究与卫生政策研究所，美国马萨诸塞州波士顿华盛顿街800号063室，邮编02111。

摘要

目的

比较两种诊断策略对疑似遗传疾病的重症婴儿1年内的医疗费用和质量调整生命年（QALYs）：1）所有婴儿在入院后7天内进行快速基因组测序；2）所有婴儿首先进行新生儿基因测序（NewbornDx），未确诊的婴儿在7天后再进行快速基因组测序（rGS）。

研究设计

“Genomic Medicine for Ill Neonates and Infants”（GEMINI）是一项多中心前瞻性研究，纳入了400名年龄在1岁以下、疑似患有遗传疾病的住院婴儿。所有参与者都接受了快速基因组测序（rGS）和新生儿基因测序（NewbornDx）。利用GEMINI的患者级数据和2023年的Medicare费用标准，我们建立了一个决策树，以比较这两种假设测试策略在1年内的总费用和QALYs。

结果

快速基因组测序（rGS）的诊断效率和前期检测费用（49%；12,297美元）高于新生儿基因测序（NewbornDx）（27%；2,449美元；p<0.05）。由于早期检测和诊断并未显著影响QALYs，我们进行了成本最小化分析，仅关注两种策略之间的费用差异。结果显示，与先进行新生儿基因测序并在必要时再进行快速基因组测序相比，早期快速基因组测序可为每位患者节省158,592美元（95%置信区间：63,701-253,292美元）。

结论

早期快速基因组测序能够显著节省医疗费用，这突显了扩大报销范围、提高重症婴儿住院早期诊断可及性的必要性。

部分内容摘要

概述

本研究分三个阶段进行：1）在GEMINI研究期间收集数据，包括诊断效率、生活质量及医疗利用情况，用于基于模型的经济评估；2）分析这些患者级数据以确定模型参数；3）根据实证结果开发决策树模型。

该研究获得了约翰霍普金斯大学单一机构审查委员会的批准。

样本特征

表II展示了早期检测与后期检测婴儿及其家庭的基线人口统计和临床特征。入组时婴儿的中位年龄为18.0天（IQR：8.0-66.2天），其中58%为男性，57%拥有公共保险。早期检测与后期检测的婴儿在入组时中位年龄（8.0天（IQR：4.0-65.0天） vs 32.0天（IQR：13.0-68.5天）；p<0.01）、平均妊娠年龄（37.2周（SD：3.1周） vs 36.0周（SD：4.0周）；p<0.01）以及出生体重（2809克（SD：817克）等方面存在差异。

讨论

我们的决策分析模型表明，在美国对疑似遗传疾病的重症婴儿进行早期快速基因组测序，可在婴儿出生后的第一年内节省超过15万美元的医疗费用。费用节省主要源于避免了后续的快速基因组测序，从而缩短了住院时间。这些结果与先前的研究一致，即快速基因组测序在住院早期应用时最具成本效益。

作者贡献

概念构思：T.A.L., J.L.M., S.F.K., J.M.D.；数据整理：C.H.L., Y.Z., B.S.；数据分析：C.H.L., Y.Z., B.S.；资金筹集：J.L.M., J.M.D.；研究实施：T.A.L., J.L.M., S.F.K., C.H.L., Y.Z., D.R., B.D.G., J.V., J.M.D.；方法学设计：T.A.L., J.L.M., S.F.K., C.H.L., Y.Z., B.S., J.M.D.；项目管理：T.A.L., J.L.M., C.H.L., Y.Z., J.M.D.；资源协调：J.L.M., S.F.K., J.M.D.；监督：T.A.L., J.L.M., S.F.K., J.M.D.；初稿撰写：T.A.L., J.L.M., C.H.L.

资助声明

本研究由国家转化科学促进中心（NCATS）（U01TR00271）资助。NCATS未参与研究的设计、实施、数据收集、分析、解释、手稿的撰写、审查或批准过程，也未参与决定手稿的发表。

临床试验注册：GEMINI研究已在ClinicalTrials.gov注册，标识符为：NCT03890679，以及https://clinicaltrials.gov/study/NCT03890679。

伦理声明

本研究获得了约翰霍普金斯大学单一机构审查委员会（IRB；JHUSIRB00000007）的批准，该委员会作为“Genomic Medicine for Ill Neonates and Infants”（GEMINI）研究的中央IRB。所有参与研究的机构均获得了IRB的批准。根据IRB的要求，所有参与者或其法定监护人签署了知情同意书。为保护参与者隐私，收集的数据已进行了去标识化处理。

论文中使用的缩写：

CGA：校正妊娠年龄；CMS：医疗保险与医疗补助服务中心；CPT：现行程序术语；GEMINI：新生儿与婴儿基因组医学；HCPCS：医疗保健通用程序编码系统；HRQOL：健康相关生活质量；IQR：四分位数范围；IRB：机构审查委员会；PSA：概率敏感性分析；QALYs：质量调整生命年；rGS：快速基因组测序；SD：标准差；SF-12：12项简式健康调查；SF-6D：

CRediT作者贡献声明

Tara A. Lavelle：初稿撰写、审稿与编辑、监督、资源协调、项目管理、方法学设计、研究实施、概念构思。Jill L. Maron：初稿撰写、审稿与编辑、监督、资源协调、项目管理、方法学设计、研究实施、资金筹集、概念构思。Stephen F. Kingsmore：审稿与编辑、监督、资源协调、项目管理、方法学设计、研究实施、资金筹集。

致谢

我们感谢参与本研究的家庭。特别感谢以下人员在招募和数据收集方面提供的帮助：Jae H. Kim博士（辛辛那提大学医学院儿科围产期研究所）、Cynthia M. Powell博士（北卡罗来纳大学儿童研究所）以及Andrea Trembath博士（北卡罗来纳大学儿童研究所）。