基于长读长测序技术，开发用于检测慢性乙型肝炎（CHB）患者血清中HBV RNA及SP1变异体的准确检测方法

《Journal of Medical Virology》：Developing an Accurate Assay for Detection of Serum HBV RNA and SP1 Variant in CHB Based on Long-Read Sequencing

长读测序揭示HBV感染患者中spliced pgRNA变体特征及核苷类似物治疗后动态变化，发现SP1变体占比最高（35%-62%），治疗后变体比例下降，并建立血清HBV RNA和SP1检测新方法，其比例与肝炎症程度相关。

　　

摘要

在接受核苷酸（NA）治疗的HBV感染者中，剪接后的pgRNA变异体的特征仍不明确，且HBV RNA或剪接后的pgRNA变异体1（SP1）的定量灵敏度和准确性有待提高。在本研究中，我们利用自主研发的长读长测序技术，分析了未经治疗和接受NA治疗的HBV感染者体内的剪接后pgRNA变异体模式。通过长读长测序，我们发现了16种已知的剪接后pgRNA变异体和41种新的剪接变异体，其中SP1变异体在所有HBV剪接RNA中占比最高，范围为35%至62%。短期NA治疗后，剪接后pgRNA占总HBV RNA的比例以及SP1占HBV RNA的比例均有所下降。此外，我们基于长读长测序结果建立了一种检测血清HBV RNA和SP1的准确方法，并评估了该方法在HBV感染者中的检测能力。使用位于SP1区域外的引物对2312/2413和1528/1600测量的血清HBV RNA水平在未经治疗和接受NA治疗的患者中表现出良好的一致性。最后，SP1占HBV RNA的比例与肝脏炎症的程度相关。因此，我们通过长读长测序确定了剪接后pgRNA的特征及其在NA治疗患者中的动态变化，为开发更准确的HBV RNA或SP1变异体检测方法提供了更多信息。

利益冲突

作者声明不存在利益冲突。