利用SSR标记对Bagrid鲶鱼（Rita rita）的遗传多样性进行评估：对河流保护的启示

《Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems》：Genetic Diversity Assessment of Bagrid Catfish (Rita rita) Using SSR Markers: Implications for Riverine Conservation

遗传多样性评估显示印度河五月鲇种群存在地理隔离和中等遗传多样性，SSR标记分析揭示种群结构分化及基因流受阻现象。

　　

摘要

了解遗传多样性对于保护和可持续管理河流生态系统中的鱼类种群至关重要。然而，过度捕捞、栖息地退化、污染以及不合理的渔业管理威胁着许多物种的遗传完整性，包括袋鲶（Rita rita）。本研究利用简单序列重复（SSR）标记来评估印度河沿岸五个地点的R. rita的遗传多样性和种群结构。从背肌组织中提取了基因组DNA，并使用来自Bagarius yarrelli的跨物种微卫星引物进行聚合酶链反应（PCR）扩增。遗传多样性的评估指标包括等位基因丰富度（Ar）、杂合度、近交系数（F_IS）和遗传分化程度（F_ST）。结果显示，该物种具有中等程度的遗传多样性，等位基因丰富度在2.400到5.800之间，预期杂合度（He）介于0.617到0.699之间。大多数种群中观察到的杂合度（Ho）较低，表明可能存在近交现象。显著的遗传分化（F_ST）表明种群结构较为明显，地理距离与遗传变异之间存在强烈相关性。分子方差分析（AMOVA）显示，85.72%的遗传变异发生在个体内部，而某些位点上的基因流受限（Nm）表明地理障碍影响了遗传多样性。UPGMA聚类和STRUCTURE分析识别出两个主要的遗传群体，表明存在不同的进化谱系。这些发现强调了制定有针对性的保护策略的必要性，以维持遗传完整性并防止进一步的遗传丧失。本研究为未来的标记辅助保护和水产养殖项目提供了分子基础，以帮助R. rita种群在其自然栖息地中持续生存。

利益冲突

作者声明没有利益冲突。