利用直接作用于生物体的策略发现2′-脱氧核苷5′-单磷酸N-糖苷酶(DNPH1)PROTACs

《Journal of Medicinal Chemistry》:Use of Direct-to-Biology Strategies for the Discovery of 2′-Deoxynucleoside 5′-Monophosphate N-Glycosidase (DNPH1) PROTACs

【字体: 时间:2025年11月04日 来源:Journal of Medicinal Chemistry 6.8

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  高效DNA损伤修复酶DNPH1的PROTACs开发与功能验证,通过直接生物学合成筛选平台快速发现纳米摩尔级降解剂,证实其依赖蛋白酶体和VHL通路实现选择性蛋白降解,在BRCA1突变细胞中协同增强hmdU敏感性。

  
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2′-脱氧核苷5′-单磷酸N-糖苷酶(DNPH1)已成为利用DNA损伤反应途径进行癌症治疗的理想靶点,但目前缺乏用于研究DNPH1生物学的化学降解剂。我们通过一种直接应用于生物学研究的合成与筛选平台,加速发现了高效的DNPH1 PROTAC(Protease-Targeting Affinity Chimera)。我们采用微型化、基于阵列的化学方法构建了一个包含多种喹唑啉类PROTAC的化合物库,这些PROTAC能够结合不同的E3连接酶。通过在细胞降解实验中对反应混合物进行筛选,我们迅速鉴定出多种纳摩尔级别的DNPH1 PROTAC,其中化合物59能够几乎完全降解DNPH1,并在BRCA1突变细胞系中表现出强烈的功能活性。机制研究表明,这些PROTAC能够选择性地通过蛋白酶体或VHL蛋白进行蛋白质降解,从而再现DNPH1基因缺失时观察到的表型变化,包括对hmdU治疗的敏感性增强。我们的研究结果展示了D2B方法在加速PROTAC开发方面的优势,并证明了基于喹唑啉的降解剂作为强大化学工具在推动DNPH1靶向癌症研究中的重要作用。

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