来自古西伯利亚永久冻土层的Paracolpoda steinii（纤毛动物门，Colpodida目）：揭示隐秘的生物多样性

《Polar Biology》：Paracolpoda steinii (Ciliophora, Colpodida) from ancient Siberian permafrost: insights into cryptic diversity

本研究通过分析西伯利亚永久冻土中保存的Holocene至晚更新世（2-45,000年）古新种和现代样本的形态与分子特征（SSU 18S rRNA、ITS区域及CBC模式），揭示Paracolpoda steinii为隐秘物种复合体，并重建其进化分化事件。

　　

摘要

我们利用现代和古代分离株研究了纤毛虫Paracolpoda steinii（纤毛门，Colpodida纲）的系统发育位置及其隐秘多样性。从西伯利亚的永久冻土层中获得了7个菌株，这些冻土层的年代可追溯至全新世和晚更新世，另外2个菌株来自当代的森林土壤及受永久冻土影响的土壤。通过放射性碳测年确定，这些古代纤毛虫的隐生状态持续时间与周围永久冻土沉积物的年龄相匹配，表层沉积物的隐生时间长达数千年，而深层沉积物的隐生时间接近45,000年。为了评估种内和种间变异，我们结合了SSU 18S rRNA基因以及ITS1–5.8S–ITS2区域的比较形态学和分子分析，包括ITS2的二级结构及补偿性碱基变化（CBC）模式。研究结果表明，P. steinii属于一个隐秘物种复合体。CBC分析揭示了显著的遗传分化，有助于重建导致谱系分化的进化事件序列。这些发现为了解P. steinii在全新世和晚更新世期间的系统发育位置及其进化动态提供了新的见解。