基于蛋白质互作组的框架揭示了化学物质的一般毒性

《Environmental Science & Technology》：A Protein Interactome-Based Framework Reveals the General Toxicity of Chemicals

提出基于蛋白互作网络的化学-疾病关联通用框架，通过比较毒理学数据库验证及斑马鱼实验和人类暴露数据集分析，成功预测未知农药毒性、解释COVID药物毒性并发现间接化学-疾病毒性模式，为毒性研究提供新范式。

　　

人类会接触到各种化学物质，了解它们的毒性对于保护健康至关重要。然而，现有的毒理学方法往往只关注特定的疾病或化学物质，而忽略了更广泛的毒性模式。在这里，我们提出了一个通用框架，将毒性概念化为化学物质与疾病之间通过蛋白质相互作用介导的关系。利用比较毒基因组学数据库，我们发现蛋白质相互作用组中化学靶点与疾病相关蛋白质之间的网络邻近性可以预测化学物质与疾病之间的关联。我们通过斑马鱼实验验证了这一发现，并分析了人类暴露组数据以研究慢性化学物质与疾病之间的相关性。我们的框架在预测一种杀菌剂之前未知的毒性效应、解释一种新冠药物的细胞毒性以及揭示被忽视的“间接影响”化学物质-疾病毒性模式方面发挥了重要作用。我们的方法为毒性研究建立了新的范式，提供了关于化学物质对健康风险的见解，并解决了公共卫生挑战。